Manual for Bruker-microCT CT-Analyser v. 1.13
2013
Page 41 of 139 
Similarly a clip plane  can be used in a similar way as the clip box (left).  
A navigation clip plane  also shows an intersection with the volume model (red 
color), but this allows navigation in the Z direction in the dataset, since movement of 
the navigation clip plane controls scrolling up and down the crossection levels in the 
CTAn dataset and crossection image panes (right). 
Note that translational movement in the CTAn volume model window is done by 
holding the keyboard CTRL button at the same time as left mouse button drag and 
drop. 
The yellow square in the bottom right corner of the volume image window shows 
translational movement by showing a second, displaced square (see images above). 
Pdf to ppt converter online - C# Create PDF from PowerPoint Library to convert pptx, ppt to PDF in C#.net, ASP.NET MVC, WinForms, WPF
Online C# Tutorial for Creating PDF from Microsoft PowerPoint Presentation
how to change pdf to powerpoint; change pdf to ppt
Pdf to ppt converter online - VB.NET Create PDF from PowerPoint Library to convert pptx, ppt to PDF in vb.net, ASP.NET MVC, WinForms, WPF
VB.NET Tutorial for Export PDF file from Microsoft Office PowerPoint
how to convert pdf to ppt using; drag and drop pdf into powerpoint
Manual for Bruker-microCT CT-Analyser v. 1.13
2013
Page 42 of 139 
7. Page 1: Raw Images 
This first page, “raw images”, is where you find yourself first after opening a dataset 
in CTAn. In this page, you can view the dataset in a number of different ways, in 
preparation to moving on to the further, analysis-related pages (2-5). There are a few 
useful functions at the raw image page that it is worth being aware of. 
After the five “page” buttons at the top left of the CTAn window, there are a further 
four buttons representing various functions. These will be described in this chapter 
on the raw images page. 
7.1. The profile bar (with MIP and other imaging 
functions) 
The profile bar turns on a number of functions such as density line profile, 
longitudinal image cuts through the dataset and maximum intensity projection (MIP) 
image generation from different angles. 
To activate the profile bar, click on the profile line button at the top button bar (circled 
in red): 
When this bar becomes active, a red line appears on the crossection image. This line 
can be re-drawn anywhere on the crossection image by left mouse drag-and-drop, 
with its beginning marked by a small circle. In a bar to the right of the crossection 
image a grey level profile along this line is drawn, and the left-hand end of this profile 
corresponds to the beginning of the line (with the small circle). 
Online Convert PowerPoint to PDF file. Best free online export
Online Powerpoint to PDF Converter. Download Free Trial. Convert a PPTX/PPT File to PDF. Just upload your file by clicking on the blue
how to change pdf to powerpoint slides; how to convert pdf to powerpoint slides
C# PDF Convert: How to Convert MS PPT to Adobe PDF Document
Our XDoc.Converter for .NET can help you to easily achieve high performance PDF conversion from Microsoft PowerPoint (.ppt and .pptx).
conversion of pdf into ppt; create powerpoint from pdf
Manual for Bruker-microCT CT-Analyser v. 1.13
2013
Page 43 of 139 
On the panel above the profile graph there are six buttons which give access to the 
following commands: 
1. Save profile  saves a text file with the results of the density profile 
line: these include the start and end pixel coordinates, the line length in 
pixels and the grey level listed at every pixel along the line 
2. Cut single slice  creation of a single longitudinal section cut along the 
profile line through the dataset, within the limits of the region of interest. 
3. Cut multiple slices  creation of a new set of images consisting of 
longitudinal section cuts along lines parallel to the profile line. 
4. Maximum or minimum intensity projection (MIP)  MIP images can 
be taken orthogonal to the profile line or axially in the z axis. 
5. A virtual projection image  a projection image is recreated by 
forward projection from the crossectional dataset, from a selected 
perspective 
6. Apply or remove the ROI  alternate between display of the image 
inside the ROI only and display of the full image 
7.1.1. Save profile 
When the save profile 
button is pressed, the profile of density along the profile line, as 
displayed in the profile window, is saved as a text file: 
The start point of the profile line is indicated by the red and white bead at one end. 
How to C#: Convert PDF, Excel, PPT to Word
How to for XImage. All Formats. XDoc.HTML5 Viewer. XDoc.Windows Viewer. XDoc.Converter. View & Process. XImage.Raster. How to C#: Convert PDF, Excel, PPT to Word
how to convert pdf into powerpoint; pdf to powerpoint slide
VB.NET PowerPoint: Process & Manipulate PPT (.pptx) Slide(s)
This VB.NET online tutorial page can help you processing control add-on can do PPT creating, loading powerful & profession imaging controls, PDF document, image
table from pdf to powerpoint; pdf to ppt converter
Manual for Bruker-microCT CT-Analyser v. 1.13
2013
Page 44 of 139 
7.1.2. Single section reslicing 
Clicking on the single scissors icon 
generates a single longitudinal cut along the red 
profile line: 
In the image dialog the first  button saves the single displayed image only, the 
second button 
applies the displayed resliced image as the dataset _spr image 
to generate the projection image, and the third button  exits the dialog. 
VB.NET PowerPoint: Convert PowerPoint to BMP Image with VB PPT
NET PPT document converter allows for PowerPoint conversion to both images and documents, like rendering PowerPoint to BMP, GIF, PNG, TIFF, JPEG, SVG or PDF.
convert pdf file to powerpoint; convert pdf into ppt online
How to C#: Convert Word, Excel and PPT to PDF
All Formats. XDoc.HTML5 Viewer. XDoc.Windows Viewer. XDoc.Converter. View & Process. XImage.Raster. Adobe PDF. How to C#: Convert Word, Excel and PPT to PDF.
how to convert pdf into powerpoint presentation; convert pdf document to powerpoint
Manual for Bruker-microCT CT-Analyser v. 1.13
2013
Page 45 of 139 
7.1.3. Multiple crossection reslicing 
Clicking on the multiple-slice scissors icon 
allows a multi-layered longitudinal cut 
along the selected profile line, so that a deep section of the dataset – up to the whole 
dataset – can be longitudinally resliced. 
The parameters for constructing such a longitudinal section dataset are set in the 
dialog box which appears. Background color indicates what color (black or white) 
will fill in areas of the new resliced images outside the boundaries of the initial 
images. Using Slice spacing you can set the distance between cuts, and 
Number of slices indicates the total number of slices in a resliced dataset. 
VB.NET PowerPoint: Read & Scan Barcode Image from PPT Slide
VB.NET PPT PDF-417 barcode scanning SDK to detect PDF-417 barcode image from PowerPoint slide. VB.NET APIs to detect and decode
convert pdf to ppt; pdf conversion to powerpoint
VB.NET PowerPoint: Use .NET Converter to Convert PPT to Raster
VB.NET PPT to raster images converter very well. Check PPT to PNG image converting sample code in VB powerful & profession imaging controls, PDF document, image
and paste pdf into powerpoint; convert pdf to editable ppt online
Manual for Bruker-microCT CT-Analyser v. 1.13
2013
Page 46 of 139 
Simultaneously with modifying these parameters, the area selected for longitudinal 
resampling changes in real time in the crossection image window. The areas outside of this 
selection are inverted. While multi-reslice is active, the crossection image background is 
displayed as pink.  
On pressing the  OK  button the process of reslicing begins, and after completion a dialog 
appears displaying the new resliced set of images. You can view through the resliced 
images by moving the slider at the bottom of the dialog. A line drawn in the resampling 
region in the crossection image corresponds to the current position selected by the slider. 
In the resliced images dialog box there are two save buttons, the first 
to save the single 
displayed image only, the second 
to save the whole stack of resliced sections. The 
next button 
allows the currently displayed image to be saved as the spr image to 
provide the projection window image, while the last button  exits the dialog. 
7.1.4. The maximum intensity projection (MIP)
The MIP function is activated by starting the profile line. In each column of voxels 
orthogonal to the selected plane, the highest density value found is assigned to that 
position in the generated image. MIP images can visualise dense structures 
surrounded by lower density medium.  
Manual for Bruker-microCT CT-Analyser v. 1.13
2013
Page 47 of 139 
MIP options: 
 Projection view: 
There are two options for the direction of the generation of the MIP image. 
These are (1) horizontal  –  meaning in the z axis, or (2) along profile, meaning 
orthogonally across the direction of the currently drawn profile line.  
 Background color: 
Here “color” means black or white  . If the background “color” is set to the 
same color as the ambient background, then the image generated will be the 
maximum intensity projection, showing the densest structures. If the color is 
set to the color of the maximum density, then the process will generate instead 
the minimum intensity projection, revealing low density inclusions. 
 Depth of projection: 
This sets the number of image slices in the chosen plane that will be sampled, 
centered around the current crossection in the case of horizontal view and the 
red line in the case of “along profile” being selected. With “along profile” 
selected, the depth of projection is displayed in real time as a shaded region 
centered along the red line. 
 Number of projections: 
The selected projection depth can either be sampled as a single MIP, if 
number of projections is set to 1 (the default value) or can be divided into a 
selected number of multiple slices. 
When the horizontal (z axis) MIP is selected, the image will sample all the 
crossection levels of the open dataset. When “along profile” is selected, a box with 
the title “depth” will appear in which you should enter the number of pixel slices to be 
sampled orthogonally to the profile line. The region thus selected for MIP imaging will 
be shown interactively – as in the white central band in the image below (the same 
as in the tool for angular reslicing – see above). Note again that the profile line can 
be either a default centrally placed horizontal or vertical line (as set in preferences, 
general tab) or a line drawn freehand in any direction and of any length. Examples of 
the images created by the MIP tool in the x (horizontal), y (vertical) and z (between 
crossections) planes, from the scan of a Microfil-infiltrated kidney, are shown below. 
Manual for Bruker-microCT CT-Analyser v. 1.13
2013
Page 48 of 139 
Setting a high value for “number of projections” allows a set of MIP slices to be taken 
through a selected part or all of the dataset. This can be a useful way of displaying 
quickly the structure of a scanned object in a limited number of MIP slices. 
Kidney microCT scan:                         (2)  Kidney microCT scan:                                                                                                                                                                                                                                                    
crossection xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxMIP, X plane (along profile, horizontal) 
Kidney microCT scan:  
(4)    Kidney microCT scan:  
MIP, Y plane (along profile, vertical)  
MIP, Z plane (“horizontal”) 
7.1.5. The virtual projection image
The button for projection 
creates a virtual projection image by forward-projection 
from the crossection dataset. Like the MIP function, you can choose the “projection 
view” between “horizontal” (i.e. operating in the axial Z plane to create a horizontal 
projection) and along profile, where the direction will be orthogonal to the projection 
line. 
The same options of background color, depth and number of projections apply to the 
virtual projection as to the MIP, as described above. 
Manual for Bruker-microCT CT-Analyser v. 1.13
2013
Page 49 of 139 
The generated image can, again, be saved or set as the dataset spr projection 
image. 
7.1.6. Apply or remove the ROI
The last button to the right under “profile” applies or removes the current ROI from 
the displayed image in the raw images page. 
Note that when the ROI button is pressed and the Roi is applied, then this will apply 
to all the sectioning and MIP / projection imaging functions associated with the profile 
line. Thus MIP images, cut slice images and virtual projection images generated at 
this page will be restricted to the ROI if the ROI button is selected. 
If this button is not selected, then the MIP images, cut slice images and virtual 
projection images will be made from the whole images, regardless of any ROI 
selection at the ROI page. 
Manual for Bruker-microCT CT-Analyser v. 1.13
2013
Page 50 of 139 
At the ROI page the ROI as shown (rotated rectangle) is applied 
Back at the raw images page, the ROI button (far right) is selected, so the ROI from 
the ROI page is applied to the displayed crossection image in the raw images page. 
At the raw image page if the ROI button (far right) is deselected, the ROI from the 
ROI page is not applied to the image – the whole image is shown. 
Documents you may be interested
Documents you may be interested