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Converting a Package from R to S-PLUS
43
Most of these scripts work by default within the package directory,
not  in  the  directory  containing  the  package  directory.  See  their
individual help topics for more information.
Differences 
Between 
S-PLUS and R 
Packages
There are specific differences between R and Spotfire S+ packages
that  do  not  make  them  completely  interchangeable.  The  key
differences:
• To do almost any work with Spotfire S+ packages, you need
to load the pkgutils library section.
• At  this  time,  there  is  only  one  repository  for  Spotfire  S+
packages, CSAN (http://spotfire.tibco.com/csan). There is
no system in place to select a mirror as there is in R.
• Spotfire  S+  package  system  does  not  support  bundles,
translations, or front ends.
Table 1.7: Package compilation scripts.
Script name
Description
src2bin
Creates the binary version of a package from source 
files. This utility installs S code and data, compiles C, 
C++ and FORTRAN code to create a shared/dynamic 
library, and formats and installs help files.
HELPINSTALL
Installs Spotfire S+ help files from .Rd source files into 
the .Data directory of a specified destination directory.
SINSTALL
Installs S-PLUS code or data objects from source files 
into the .Data directory of a specified destination 
directory.
DATAINSTALL
Install S-PLUS code or data objects from source files 
into the .Data directory of a specified destination 
directory.
SHLIB
Creates a shared library from C, C++, or FORTRAN 
source files. The source files are compiled and resulting 
object files are linked to make a shared library. A 
shared library is also known as a shared object, 
dynamic library, or dynamic shared object.
Delete pages pdf files - remove PDF pages in C#.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WinForms, WPF
Provides Users with Mature Document Manipulating Function for Deleting PDF Pages
delete pdf pages ipad; reader extract pages from pdf
Delete pages pdf files - VB.NET PDF Page Delete Library: remove PDF pages in vb.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WinForms, WPF
Visual Basic Sample Codes to Delete PDF Document Page in .NET
copy pages from pdf to word; delete page from pdf file online
Chapter 1  Spotfire S+ Guide to Packages
44
• C  and FORTRAN code  is automatically loaded in Spotfire
S+  packages when the  package is  attached  with the library
function.  This  is  done  through  the Spotfire  S+ feature  that
automatically  loads  the  file  named  S.so  or  S.dll  in  the
directory  being  attached.  This  means  there  is  no  need  to
explicitly  write a  .First.lib  function  that loads the  packages
shared library.
• Spotfire S+ package system uses only the current Spotfire S+
help system.
The .Rd files are converted to HTML on UNIX/Linux, and
to  a  .chm  file  on  Windows.  LaTeX  help  files  are  not
supported at this time.
• The Sweave system is not supported. 
• The data directory in a Spotfire S+ source package can only
contain  ASCII  data  objects  created  with 
dump()
 space-
delimited data files (.txt), or comma-delimited files (.CSV). R
binary objects (.rda files) are ignored by S-PLUS. 
• Spotfire S+ does  not have 
NAMESPACES
so  any references  to
them in a package needs to be modified to work in S-PLUS.
• The first argument to 
.Call
must be a a string in S-PLUS. R
allows the first argument to 
.Call
to be a variable.
• The  default  storage  mode  for  a  numeric  value  with  no
decimal  place  in  S-PLUS  is  an  integer,  while  in  R  it  is  a
double. For example, in S-PLUS:
x <- 3
storage.mode(x)
[1] "integer"
While in R:
x <- 3
storage.mode(x)
[1] "double"
If you parse the R functions with 
set.parse.mode("R")
, the
numeric values without decimal points in the R functions are
parsed as doubles, for example, in S-PLUS:
C# PDF File & Page Process Library SDK for C#.net, ASP.NET, MVC
Page Process. File: Merge, Append PDF Files. File: Split PDF Document. File: Compress PDF. Page: Create Thumbnails. Page: Insert PDF Pages. Page: Delete Existing
delete pages of pdf preview; delete page on pdf
C# PDF Page Insert Library: insert pages into PDF file in C#.net
how to merge PDF document files by C# code, how to rotate PDF document page, how to delete PDF page using C# .NET, how to reorganize PDF document pages and how
delete blank page in pdf online; delete pages from pdf in preview
Converting a Package from R to S-PLUS
45
set.parse.mode("R")
x <- 3
storage.mode(x)
[1] "double"
x
If you have a *.R file that can only be read correctly when
parsed in R mode (because it uses underscores in the name or
it relies on 
"1"
 a double precision number), you can parse it
and deparse it (with 
dump
or 
deparse
) to make a new file that
can be read identically in either R or S-PLUS mode.
• The  first  component  in  the  return  list  from  the 
integrate
function is named 
"integral"
in S-PLUS and 
"value"
in R.
Portable code that uses 
integrate
should access the first value
in  the  list  by  position 
(z[[1]])
instead  of  by  name
(z$integral or z$value)
.
Porting Tools
 useful  tool  for  porting  R  packages  to  S-PLUS  is  the
unresolvedGlobalReferences
function introduced in Spotfire S+ 8.0.
This function looks for undefined functions and data in S-PLUS or R
source files. It returns the names of all undefined items and the names
of the files and functions where they are referenced.
The 
unresolvedGlobalReferences
function can look at list of source
files,  or  you  can  point  the  function  to  a  directory  containing  the
source files. The function analyzes all files in the directory that end
with .q, .ssc, .S, or .R.
When  you  port  a  package  from  R  to  S-PLUS,  you  can  call
unresolvedGlobalReferences
with  the 
dir
argument  set  to  the  R
subdirectory in the package source tree.
The following example shows a partial listing of calling the function
unresolvedGlobalReferences(dir="R") 
in  the  randomForest
package directory that was just downloaded from CRAN:
unresolvedGlobalReferences("R")
.
.
$"R/classCenter.R#classCenter":
[1] "max.col" "mapply"
.
.
C#: How to Delete Cached Files from Your Web Viewer
Convert Jpeg to PDF; Merge PDF Files; Split PDF Document; Remove Password from PDF; C# File: Split PDF; C# Page: Insert PDF pages; C# Page: Delete PDF pages; C#
delete pages pdf preview; acrobat extract pages from pdf
VB.NET PDF File Merge Library: Merge, append PDF files in vb.net
Merge two or several separate PDF files together and into one PDF document in VB.NET. Combine multiple specified PDF pages in into single one file.
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Chapter 1  Spotfire S+ Guide to Packages
46
$"R/classCenter.R#classCenter#<anonymous-1>":
[1] "cls"
$"R/classCenter.R#classCenter#<anonymous-2>":
[1] "idx"   "label"
$"R/classCenter.R#classCenter#<anonymous-3>":
[1] "x"
.
.
This  shows  the 
classCenter
function  defined  in  the  file
classCenter.R referencing the functions 
max.col
and 
mapply
. These
functions are not defined within the package files, nor do they appear
in  the  current  Spotfire  S+  search  path.  The 
mapply
function  is
contained in the pkgutils library; If you attached the library before
running 
unresolvedGlobalReferences
mapply
would not be flagged.
The 
max.col
function is defined in the MASS library that ships with
Spotfire S+. To make a portable 
classCenter
function that would run
in both S-PLUS and R, one would add the following lines before the
two functions were called in the 
classCenter
function:
if(!is.R() {
if(!existsFunction("max.col")) library(MASS)
if(!is.R() && !existsFunction("mapply")) library(pkgutils)
}
The 
<anonymous-1>
<anonymous-2>
and 
<anonymous-3>
references in
classCenter
typically indicate use of  R scoping  rules  in calls  to  a
function in the 
apply
family (
lapply
sapply
apply
, and so on).
Typically,  you  can  fix  these  by  passing  the  function  arguments
explicitly to the function being called by the 
apply
function.
To  make  a  portable  fix  for  the  unresolved 
cls
object,  use  the
following code:
if(is.R()) {
ncls <- sapply(clsLabel, function(x)
rowSums(cls == x))
} else {
ncls <- sapply(clsLabel, function(x, cls = cls)
rowSums(cls == x), cls = cls)
}
C# PDF File Split Library: Split, seperate PDF into multiple files
can split target PDF document file by specifying a page or pages. If needed, developers can also combine generated split PDF document files with other PDF
delete a page from a pdf; delete pages of pdf
C# PDF Convert to HTML SDK: Convert PDF to html files in C#.net
How to Use C#.NET Demo Code to Convert PDF Document to HTML5 Files in C#.NET Class. Add necessary references: RasterEdge.Imaging.Basic.dll.
delete pdf pages online; delete pdf pages in preview
Converting a Package from R to S-PLUS
47
See  the  help  file  for 
unresolvedGlobalReferences 
for  more
information and examples.
Trouble-
Shooting 
Porting R 
Packages
R and S-PLUS are different dialects of the S language; each dialect
has capabilities that are not implemented in the other dialect. The "R
and S" section of the R FAQ, available at 
http://www.ci.tuwien.ac.at/~hornik/R/R-FAQ.html#R-and-S
has a long section on the differences. Some of the key differences that
you might encounter when trying to get an  R  package  to  work  in
S
-
PLUS are listed here. 
Scoping Rules
S-PLUS functions  search for objects in the current frame,  frame 1,
frame 0, and then the attached databases. R searches for objects in the
following order:
1. Current frame ("environment")
2. The  environment  of  the  function  in  which  the  current
function is defined, not called. 
3. The environment in which the definer of the current function
was defined, etc., until it gets to the global environment.
This difference often causes problems with calls to the 
lapply
family
of functions. In S-PLUS, you need to pass all objects included in the
FUN
function as arguments to 
FUN
, and include those  arguments by
name in the 
lapply
call. For example:
nsamp <- 10
lapply(z, function(x, nsamp) {
mean(sample(x, size=nsamp, replace=T))
}, nsamp=nsamp)
The scoping  rule  difference  also  shows  up  in  calls to optimization
functions,  e.g., 
optim()
inside  of  functions.  You  need  to  pass  all
objects referenced inside the function being optimized as arguments
to that function.
For more information about dealing with scoping problems, see the
section Porting Tools on page 41.
VB.NET PDF File Split Library: Split, seperate PDF into multiple
split target multi-page PDF document file to one-page PDF files or they can separate source PDF file to smaller PDF documents by every given number of pages.
delete page pdf online; delete page from pdf document
VB.NET PDF Convert to HTML SDK: Convert PDF to html files in vb.
' Convert PDF file to HTML5 files DocumentConverter.ConvertToHtml5("..\1.pdf", "..output\", RelativeType.SVG). Copyright © <2000-2016> by <RasterEdge.com>.
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Chapter 1  Spotfire S+ Guide to Packages
48
Missing C/
FORTRAN 
Functions
S-PLUS and R contain different internal C functions and FORTRAN
subroutines.
Sometimes  the  underlying  code  is  the  same  but  the  function  or
subroutine name differs between the two systems. Any calls to C or
FORTRAN  code  not included as  source  in the package  should  be
checked.
Some known missing C code:
• R has a collection of bessel functions from netlib that are not
yet in S-PLUS.
• R has its exponential random number generator available for
calling  from  C,  but  S-PLUS  does  not.  The  uniform  and
gaussian random number generators are available in S-PLUS. 
Differences between R and S-PLUS
49
DIFFERENCES BETWEEN R AND S-PLUS
R and S-PLUS have certain differences that you should be aware of if
you are working in both, or if you are translating packages from one
to another.
You can  find  information about the differences on  the  Spotfire S+
Support Web site:
http://support.tibco.com
Also, you can use your Internet search engine to find other resources
that list differences.
Chapter 1  Spotfire S+ Guide to Packages
50
51
Overview
52
Components of A Spotfire S+ GUI
53
Menus and Menu Items
54
Control Properties
55
FunctionInfo Object
55
The menu Function
55
The callback Function
55
GUI Example
57
Creating the Menu
57
Creating the Calling Function
59
Creating the Dialog
60
Creating the FunctionInfo Object
63
Creating the Callback Function
64
Loading the GUI at Startup
66
Removing the Menu at Shutdown
67
The Resulting Dialog
68
Extending The Example
69
Additional Properties
69
Dialog Pages
70
Updating the Menu Funcion
70
Updating the FunctionInfo Object
71
The Resulting Dialog
73
Building The GUI During Installation
74
Basic Code Structure
74
ADDING A GUI TO A 
WINDOWS
®
PACKAGE
2
Chapter 2  Adding A GUI To a Windows
®
Package
52
OVERVIEW
You can program the Spotfire S+ for Windows Graphical User 
Interface (GUI) using the Spotfire S+ language; therefore, you can 
add a GUI to a package to give users access to the functions you have 
created via a GUI as well as via the command line interface. Using 
the functions that control GUI customization, you can create menus, 
menu items, and control properties (such as drop-down lists for 
selecting options, check boxes,  input fields, and grouping structures 
for grouping properties on the pages of a dialog). 
• The special structure, the 
FunctionInfo
object, aligns the 
control properties in the dialog. These controls accept input 
from the user, with the arguments of a function that is called 
when the user clicks OK or Apply. 
• The special function, 
callback
, is associated with the dialog 
that manages information in the control properties. For 
example, if you select a data frame as the object to apply your 
function to, you might want to display the column names in a 
drop-down list for selection. In this case, the 
callback
function is used to change the content of a drop-down  list  
dynamically, depending on the content of another property.
This section is designed to:
• Give you an introduction to building Spotfire S+ GUIs.
• Describe the required directory structure where your GUI 
creation code goes to ensure it is loaded during package build 
and installation.
If you have created a custom GUI for your package already, there is a 
simple directory and file structure that you must follow in order for it 
to be included in the installed package.To understand that structure 
see section Building The GUI During Installation on page 74. If you 
haven’t created a GUI but would like to, the following sections 
provide some guidance for doing that. 
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