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Capturing Image Sequences
141    PerkinElmer          
Capturing Image Sequences
1. Click the capture button to acquire an image sequence using the current acquisition protocol. 
Once capture has started a red dot is shown on the Video Preview and the capture button changes to 
a stop button. 
If you have configured your acquisition protocol to acquire a fixed number of timepoints, the protocol 
will stop when the correct number of timepoints has been acquired. If you wish to stop the protocol 
before the end is reached, or if you have chosen the Capture until stop is pressed option, you must 
click the Stop icon on the Video Preview window. 
You may re-run your acquisition protocol by selecting the Capture icon as many times as you wish.
Pause Acquisition while Capturing 
Any timepoints that have been partially acquired when you select pause will be completed before the 
acquisition is paused. Once partially acquired timepoints are completed no further acquisition will take 
place until the acquisition is resumed.
While acquisition is paused the pause button is highlighted and the red record icon in the top left 
corner of the Video Preview window changes to a gray pause icon.
ɸ
To resume acquisition click the highlighted pause button. 
ɸ
To stop acquisition whilst paused click the capture/stop button.
If a timepoint is overdue when you resume acquisition, it will be acquired immediately and at the time 
intervals that you have specified in the time-lapse options thereafter. 
Freeze the Video Preview
When viewing a live image, an acquisition protocol is not running. Freezing the preview will leave the 
last captured frame visible on the screen but will close any shutters associated with the current light 
path. This allows an image to be viewed and evaluated without exposing the sample to further 
illumination light.
When an acquisition protocol is running, freezing the preview will not affect any of the settings 
controlled by the protocol but the preview will not update with each captured frame. This maximizes 
the resources available to the acquisition and can improve performance.
While the Video Preview is frozen, the snowflake icon and the text “Preview frozen” will be shown in 
the top left-hand corner.
Click the capture button to acquire an image sequence using the current acquisition 
protocol.
Once capture has started a red dot is shown on the Video Preview and the capture button 
changes to a stop button.
The shortcut key F6 starts/stops the acquisition.
Capture a single frame of your acquisition protocol at any time.  The space bar will also 
capture a single frame. To capture a single timepoint at the current XY position go to the 
Video menu and select Capture Timepoint.
You may pause acquisition by selecting the pause button during acquisition of an image 
sequence.
Freeze the image being shown in the Video Preview.  This has two effects:
Reorder pages in pdf online - re-order PDF pages in C#.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WinForms, WPF
Support Customizing Page Order of PDF Document in C# Project
move pdf pages online; move pages in pdf file
Reorder pages in pdf online - VB.NET PDF Page Move Library: re-order PDF pages in vb.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WinForms, WPF
Sort PDF Document Pages Using VB.NET Demo Code
how to reorder pdf pages; moving pages in pdf
Volocity Acquisition Installation and Reference
September 2011  142
Acquisition Feedback 
The acquisition protocol feedback panel provides a graphical summary of the current acquisition 
protocol.  Double clicking on the acquisition protocol feedback panel opens the acquisition setup 
dialog.
A more detailed summary is displayed in the acquisition feedback panel tooltip (move the cursor over 
the LCD display to see the tooltip).
Click on the number in the timing feedback panel to toggle between the feedback modes. The display 
changes to show:
Note: If Capture until stop is clicked was selected in the Acquisition Setup window, the Remaining 
option will display the approximate time or timepoints remaining until your hard disk is full.
Multiple timepoints
Multiple timepoints and multiple Z sections
Multiple timepoints, multiple Z sections, and multiple channels
the elapsed time
the number of elapsed timepoints
the remaining time
the number of remaining timepoints
the time until the next timepoint
C# TIFF: How to Reorder, Rearrange & Sort TIFF Pages Using C# Code
Reorder, Rearrange and Sort TIFF Document Pages in C#.NET Application. C# TIFF Page Sorting Overview. Reorder TIFF Pages in C#.NET Application.
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Events and Logs 
143    PerkinElmer          
Events and Logs 
If something happens while observing acquisition that you wish to record:
1. Click on the Event flag. 
Note: The shortcut key F7 creates an event.
2. Enter the appropriate text to identify the event.
3. Click Create. 
The text will be stored in the Experiment Log of the image sequence. 
ɸ
All of the image sequences that you acquire with Volocity Acquisition will have an 
Experiment Log View, which can be displayed by selecting the Experiment Log tab.  
ɸ
The settings that were used for acquisition and any events that you recorded during 
acquisition are recorded in the Experiment Log. 
Read PDF in Web Image Viewer| Online Tutorials
"This online guide content is Out Dated! Extract images from PDF documents; Add, reorder pages in PDF files; Save and print PDF as you wish;
reorder pages in a pdf; change page order pdf
C# PDF: C# Code to Process PDF Document Page Using C#.NET PDF
C# PDF Page Processing: Sort PDF Pages - online C#.NET tutorial page for how to reorder, sort, reorganize or re-arrange PDF document files using C#.NET code.
reorder pages in pdf reader; how to reorder pages in pdf online
Volocity Acquisition Installation and Reference
September 2011  144
PerkinElmer UltraVIEW
®
The UltraVIEW VoX is a complete system for live cell imaging using the CSU-X1 spinning disk head 
from Yokogawa®.
The system consists of: 
ɸ
CSU-X1 spinning disk
ɸ
Emission filter wheel
ɸ
Modular laser system
ɸ
Piezo focus
ɸ
CCD camera
ɸ
Brightfield shutter
ɸ
ProSync™ control box
Optional accessories include the PhotoKinesis™ accessory and a motorized XY stage.
VB.NET TIFF: Modify TIFF File by Adding, Deleting & Sort TIFF
Users can use it to reorder TIFF pages in ''' &ltsummary> ''' Sort TIFF document pages in designed powerful & profession imaging controls, PDF document, image
pdf reorder pages; rearrange pages in pdf file
C# PDF Page Rotate Library: rotate PDF page permanently in C#.net
Online C# class source codes enable the ability to rotate single NET, add new PDF page, delete certain PDF page, reorder existing PDF pages and split
reorder pages pdf; pdf reverse page order online
Configuring the UltraVIEW in Preferences
145    PerkinElmer          
How does the spinning disk illumination work?
Configuring the UltraVIEW in Preferences
For the hardware of the spinning disk device to be correctly identified and controlled in Volocity it must 
be configured in the preferences. There are two devices which communicate with Volocity via serial 
ports: UltraVIEW Dichroic (within the CSU head) and the UltraVIEW ProScan™ II Controller.
The following information assumes the hardware has been installed and aligned by a qualified 
PerkinElmer service engineer. These settings will also have been configured at installation but are 
provided here for reference.
1. Select Preferences from the Edit menu (Windows) or the Volocity menu (Mac OS). 
2. Choose Serial Ports from the list. The serial ports detected on the system will be listed and to 
connect a device in Volocity its name must be selected against the port to which it is physically 
connected.
C# Word: How to Create Word Document Viewer in C#.NET Imaging
Offer mature Word file page manipulation functions (add, delete & reorder pages) in document viewer; (Directly see online document viewer demo here.).
how to reorder pdf pages in; how to move pages in a pdf document
VB.NET TIFF: VB.NET Sample Code to Process & Manage TIFF Page
certain TIFF page, and sort & reorder TIFF pages in Process TIFF Pages Independently in VB.NET Code. powerful & profession imaging controls, PDF document, image
pdf rearrange pages; change page order pdf acrobat
Volocity Acquisition Installation and Reference
September 2011  146
3. Scroll to the Devices pane and select the controls to be displayed in the Video Controls panel. 
Devices unchecked in this list will not be seen in the Video Controls panel and therefore cannot be 
controlled from that view.
4. Next to the UltraVIEW item click Options... to configure the lasers present on the system. Select 
the UltraVIEW model from the list. Laser lines are not automatically detected.
5. Check the box next to laser line(s) that are present on your system. The 488 nm laser is standard 
on all systems; therefore, this option will be checked and cannot be changed.  Choose either 561 
nm or 594 nm laser, it is not possible to have both on a system.
6. Select the dichroic set present and filters populating emission filter wheel 1 and 2 (if present).
7. Next to the UltraVIEW Focus Drive item click Options... to configure the range of travel for the 
piezo focus drive.
For the objective piezo drive this distance is 100 micrometers. For the stage insert this distance will be 
200 micrometers or 400 micrometers. Check the specification of your particular system.
If the microscope focus is also controlled by Volocity it will have its own entry under the heading of the 
microscope. The piezo focus drive will be the fastest to use in experiments but the microscope focus 
UltraVIEW Controls
147    PerkinElmer          
might have a greater range of travel. Where both are available either may be chosen to acquire stacks 
in the Acquisition Setup dialog, which is used to configure the experiment. 
Multi Camera Systems
For a system with more than one camera each camera, and its available controls, will be listed.  If all 
the cameras are checked in the list of devices the choice of camera to use in the Video Preview can 
be made there, in the Video menu under Source.  If two identical cameras are to be used for 
simultaneous imaging the Multi Camera source must be enabled in these device preferences.
UltraVIEW Controls
When the UltraVIEW is correctly configured in the preferences the following controls will be visible in 
the Video Controls.  
1. Select Show Video Preview... from the Window menu to see these controls and the live video.
Discrimination Mode
When experiments are carried out using multiple wavelengths two different methods of capture can be 
used: emission discrimination or fast sequential.
Emission Discrimination mode will restore the emission filter wheel position associated with the light 
path. Changing the emission filter provides better discrimination between different dyes in one 
sample. The disadvantage of Emission Discrimination is a reduction in capture speed, due to the time 
taken for the emission filter wheel to turn from one position to another.
In Fast Sequential mode the filter wheel is not moved during the experiment. Instead the wheel is 
automatically turned to the position containing the appropriate broadband barrier filter for the current 
dichroic to prevent laser breakthrough. Any emission filter wheel positions stored with light paths will 
Volocity Acquisition Installation and Reference
September 2011  148
be ignored in fast sequential mode. Fast sequential provides the highest capture speed, as switching 
between lasers is very quick. However, because the same broadband emission filter is used for all 
images, there is an increased risk of crosstalk between the emissions of different dyes. 
The emission filter wheel position must be stored in the light paths that are switched between by the 
acquisition protocol for emission discrimination mode to work correctly.
Dichroic
Switch between the dichroics installed in the CSU head using this pop-up. Some dichroics are only 
compatible with specific laser lines. This will be indicated in the interface as the lines that are not 
compatible with the current dichroic are grayed out.
Laser Power
One laser power slider will be shown for each line configured in the preferences. The higher the power 
used the more excitation light will be sent to the sample. This may increase the emission signal 
allowing shorter exposures to be used, however it will also lead to faster photobleaching and possible 
phototoxic effects.
Preparing to Use the UltraVIEW in Volocity
In order to use the UltraVIEW with Volocity all hardware must be configured.
ɸ
Components of the UltraVIEW which connect via the ProSync controller and serial ports 
must be connected, switched on and configured in the Volocity preferences.
ɸ
Camera drivers must be installed, the camera connected and switched on. The camera will 
then be automatically recognized in the Devices list in the Volocity preferences. 
If using a motorized microscope that must be connected to a serial port on the computer, use the 
serial cable supplied by the manufacturer. If there are no spare serial ports, it may be necessary to 
use a serial adapter. 
1. Choose Show Video Preview... from the Window menu to see the image from the camera and 
the controls for the devices.
2. Select the camera to use from the Video menu Source list.  
3. Select the appropriate light path through the microscope and CSU head to direct the image to the 
chosen camera.  If selecting a Multi Camera source for simultaneous imaging select the port on 
the CSU head which will place the image splitting dichroic in the light path.  
Ensure the alignment of the cameras has been calibrated.
4. To ensure images are correctly calibrated set calibrations for each lens position. Calibration is 
then applied to each image according to the lens in position when it is acquired.
Light paths may be created for each of the laser lines to enable easy switching between excitation and 
emission wavelengths for different fluorochromes. It is advisable to create light paths using the 
Preparing to Use the UltraVIEW in Volocity
149    PerkinElmer          
Emission Discrimination mode of the UltraVIEW, and for each laser line set and store the laser line, 
filter wheel position and set the laser shutter to open.  
These light paths will then work satisfactorily with both Emission Discrimination and Fast Sequential 
modes. Storing other settings with these light paths are a matter of personal preference and will vary 
depending on how the system is being used. For more information see“Configuring the Light Path 
Manager” on page 121.
If using a multi camera video source for dual simultaneous imaging each light path will specify two 
channels.  Remember to store laster lines and emission filters for both channels.
If the image generated by the confocal head does not fill the full field of view, adjust the CCD active 
area using CCD Active Area... dialog accessed from the Video menu.
Volocity Acquisition Installation and Reference
September 2011  150
PhotoKinesis™ Accessory
If the optional PhotoKinesis accessory is included in the UltraVIEW system there devices listed in the 
Preferences.
1. Click Options... to set laser power for bleaching. This dialog is also accessed from video controls 
while configuring an experiment.
PhotoKinesis Controls
Controls for the PhotoKinesis unit are displayed in the Video Previews including FRAP.
ɸ
Use the Fire button to fire the bleaching laser at the selected power at any time.  Double 
click on the icon for this control to configure bleaching laser power.  The FRAP Acquisition 
setup dialog creates an experimental protocol that automatically fires the bleaching laser 
after the predetermined pre-bleach images have been acquired however in other 
experiments such as  photoactivation or photo uncaging firing the bleach laser manually 
may be required.  The keyboard shortcut for firing the laser is 'B'.  In the Video Preview it 
may be applicable to configure an acquisition protocol to capture images at defined time 
intervals and manually fire the laser at some point during this.
ɸ
Use the Cycles control to repeat the bleach scan over a region.  More cycles with lower 
laser powers better achieve the depth of bleaching required with less cell damage.
ɸ
Use Spot Period to define the length of time the spot will be bleached for.  Use the Spot 
tool in the FRAP Preview to mark spot locations.
ɸ
Use Spot Size to select between three spot sizes available.  Actual spot size in the image 
plane will depend on the optics of the system and is measured during calibration.
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