c# show a pdf file : Reorder pages in pdf document software control dll winforms azure windows web forms VolocityuserGuide16-part770

XY Stage, Multi-Point Acquisition Process 
161    PerkinElmer          
1. Select Apply Focus Map... from the Stage menu.
2. You should focus on your sample anywhere on your cell substrate and click Apply on the dialog 
that opens. 
3. Your focus map should now be applied at the correct Z depth. 
Saving and Restoring Points
1. To save a set of acquisition points, select Save Points... from the Stage menu. 
2. Enter a descriptive name for your points in the dialog that opens and select Save.
3. To restore previously saved acquisition points select Restore Points... from the Stage menu. 
Select your points from the list and select Restore.
Scanning
Note: Always make sure that the lenses are calibrated accurately and that the camera head is 
positioned squarely on the microscope before scanning. We also recommend that you enable binning 
on your camera prior to scanning; this will allow Volocity to scan fields of view more quickly. 
You can set up scanning areas in three ways. You can scan regions of interest, whole wells from 
overlays, or you can scan acquisition points. 
Scanning Regions of Interest
1. Set a region of interest by selecting the ROI tool, clicking and holding the mouse, and dragging out 
a region of interest on the XY Stage view.
You can also set an ROI in several steps by moving the stage to opposite corners of your ROI.
2. Move the stage to the top left hand corner of you region of interest and select  Set ROI Top-Left 
from the Stage menu.
3. Move the stage to the bottom right-hand corner and select Set ROI Bottom-Right from the Stage 
menu.
4. Once you have set a region of interest, select Scan Selected Area from the Stage menu.
Reorder pages in pdf document - re-order PDF pages in C#.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WinForms, WPF
Support Customizing Page Order of PDF Document in C# Project
how to rearrange pages in a pdf document; how to rearrange pdf pages online
Reorder pages in pdf document - VB.NET PDF Page Move Library: re-order PDF pages in vb.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WinForms, WPF
Sort PDF Document Pages Using VB.NET Demo Code
reorder pages in pdf file; reordering pdf pages
Volocity Acquisition Installation and Reference
September 2011  162
Scanning Enabled Wells
After making an overlay and ensuring that only the relevant wells are enabled, select Scan Enabled 
Wells from the Stage menu. Volocity will scan all fields of view within the enabled wells.
Use the zoom tool to zoom on scanned areas. This will help you to find areas of interest in your 
specimen.  
Note: The shortcut key Z selects the zoom tool.
C# TIFF: How to Reorder, Rearrange & Sort TIFF Pages Using C# Code
C# TIFF - Sort TIFF File Pages Order in C#.NET. Reorder, Rearrange and Sort TIFF Document Pages in C#.NET Application. C# TIFF Page Sorting Overview.
rearrange pdf pages in preview; rearrange pdf pages reader
VB.NET PowerPoint: Sort and Reorder PowerPoint Slides by Using VB.
Sort and Reorder PowerPoint Slides Range with VB.NET amount of robust PPT slides/pages editing methods & profession imaging controls, PDF document, image to
how to move pages within a pdf document; reorder pages in pdf
XY Stage, Multi-Point Acquisition Process 
163    PerkinElmer          
Scanning Acquisition Points
1. After you have added your acquisition points, select Scan Points from the Stage menu. Volocity 
will scan your specimen and acquire a field of view for each of your acquisition points.
2. Capture snapshots of scanned areas by selecting Capture Snapshot from the Stage menu. Each 
well that you have scanned will be captured as a separate snapshot.
Note: The shortcut key F5 captures a snapshot.
Set Up and Run the Acquisition Protocol 
After storing points in the stage area, and creating a focus map if required, an acquisition protocol is 
used to image the points. 
C# PDF: C# Code to Process PDF Document Page Using C#.NET PDF
C# PDF Page Processing: Sort PDF Pages - online C#.NET tutorial page for how to reorder, sort, reorganize or re-arrange PDF document files using C#.NET code.
change pdf page order online; how to reorder pages in pdf reader
C# PDF Page Rotate Library: rotate PDF page permanently in C#.net
with the functions to merge PDF files using C# .NET, add new PDF page, delete certain PDF page, reorder existing PDF pages and split PDF document in both
how to rearrange pages in pdf using reader; switch page order pdf
Volocity Acquisition Installation and Reference
September 2011  164
1. In the Video menu select Acquisition Setup... or double-click on the acquisition protocol 
feedback display on the Video Preview window. Select the Points tab.  
2. Select an XY stage from the drop down menu to activate multi-point acquisition within the 
acquisition setup.
3. Configure the Channels/Z tab to capture more than one channel and/or a stack at each XY 
location, if applicable.  Lightpaths and focus drive top and bottom positions must be stored in the 
Video controls.
4. Configure the Time tab to set timelapse and duration of the experiment to repeat the channel(s)/
stack at each location multiple times.
5. Configure other tabs as required.  For more details about configuring a tab see “Acquisition Setup 
Dialog ” on page 128.
AutoFocus 
If the system includes a hardware device to maintain constant focus such as a Perfect Focus, or Zero 
Drift device select the device from the pop-up.  Volocity will activate the focus device to maintain the 
offset specified at the beginning of the experiment each time the autofocus is used.  See the Volocity 
Supported Hardware list for details of such devices supported by Volocity and specific instructions for 
each supported device in the technical note library at http://www.cellularimaging.com/support
When using one of these devices is not necessary to have the sample illuminated therefore the light 
path used for auto focus can be one in which shutters are closed or illumination intensity is low, this 
will protect the sample.
To use an image based auto-focus use one of the focus controllers on the system such as the 
microscope focus or piezo.  Use the fastest focus device available on the system for best results.  
Autofocus operates by seeking the highest contrast image when sampling within a range in the z-axis.  
Select the light path that you wish to use for autofocusing from the drop-down menu.  This must be a 
light path that generates an image but detected by the camera but to protect the sample could be a 
light path that is not acquired during the experiment such as one for Brightfield illumination.
If you choose to autofocus during the acquisition, you can also set timing options by 
selecting the “timing” icon.
Read PDF in Web Image Viewer| Online Tutorials
Extract images from PDF documents; Add, reorder pages in PDF files; detailed information for reading and editing PDF in RasterEdge Web Document Viewer
how to move pages in pdf reader; rearrange pdf pages
VB.NET TIFF: Modify TIFF File by Adding, Deleting & Sort TIFF
Users can use it to reorder TIFF pages in &ltsummary> ''' Sort TIFF document pages in designed powerful & profession imaging controls, PDF document, image to
move pages in pdf online; move pages within pdf
XY Stage, Multi-Point Acquisition Process 
165    PerkinElmer          
You may choose to autofocus at each point, or at each well. If you choose to autofocus at each point, 
each point will have its own focus point. If you choose to autofocus for each well, all the points within a 
well will share a common focus point.
You may also choose to auto-focus for every timepoint, to only auto-focus for the first timepoint, or to 
auto-focus periodically.
Each of your acquisition points will be treated as zero, regardless of its actual Z value.  So the 
distance between zero and your top and bottom position will be the same as the distances between 
each of your points and their top and bottom positions (see the tables below for examples). You can 
quickly check what values are set for top and bottom by inspecting the focus drive tool tip.
Top and Bottom marks with top set to 5 and bottom set to -5
Top and Bottom marks with top set to 10 and bottom set to –10.
If you wish to change the top and bottom positions, use the commands in the focus drive drop-down 
menu.
Note: You should avoid re-setting the zero value of your focus drive after setting your acquisition 
points. If you do so, you will invalidate the Z coordinates stored with each point.
Position (Z) of 
acquisition point 
(µm)
Bottom mark 
for acquisition 
(µm)
Top mark for 
acquisition 
(µm)
0
-5
5
10
5
15
20
15
25
30
25
35
Position (Z) of 
acquisition 
point (µm)
Bottom mark 
for acquisition 
(µm)
Top mark for 
acquisition 
(µm)
0
-10
10
10
0
20
20
10
30
30
20
40
C# Word: How to Create Word Document Viewer in C#.NET Imaging
in C#.NET; Offer mature Word file page manipulation functions (add, delete & reorder pages) in document viewer; Rich options to add
change pdf page order preview; change page order pdf reader
.NET Multipage TIFF SDK| Process Multipage TIFF Files
upload to SharePoint and save to PDF documents. View, edit, insert, delete and mark up pages in multi Easily add, modify, reorder and delete TIFF tags; Perfectly
pdf page order reverse; how to rearrange pages in a pdf file
Volocity Acquisition Installation and Reference
September 2011  166
If you have not set the top and bottom positions either side of zero, you may get the following warning. 
We recommend that when this warning is generated you stop the acquisition and check your top and 
bottom positions. In situations where the top and bottom are a long way from zero there is a danger 
that the focus drive may move long distances during the acquisition. This may result in damage to 
your microscope or specimen.
Volocity visits each acquisition point and conducts your acquisition protocol. The number of times 
Volocity visits each point is determined by the duration option that you set with the protocol, the 
frequency is determined by the time lapse option that was set on the Video Preview window.
Each acquisition point has its own image sequence. All the image sequences from a single multi-point 
acquisition are organized within a folder in your library.
FRAP Acquisition
Volocity provides full support for observing and analyzing the movement of intracellular materials after 
photobleaching of fluorescence. It supports both Fluorescence Recovery after Photobleaching 
(FRAP) and Fluorescence Loss in Photobleaching (FLIP) analysis.
FRAP Acquisition and Analysis functionality are provided by the FRAP plugin. This is an additional 
module available for purchase which extends the functionality of Volocity Acquisition to add features 
specifically for FRAP acquisition and extends the functionality of Volocity Quantitation for analysis of 
data acquired with the FRAP acquisition.  
The FRAP plugin requires both Volocity Acquisition and Volocity Quantitation to function.
The FRAP Preview
This section describes features that are specific to the FRAP Preview window or are of particular 
relevance to the FRAP Preview window.
ɸ
To display the FRAP preview select Show FRAP Preview from the Window menu or 
select the FRAP Preview icon in the library view.  
FRAP Acquisition
167    PerkinElmer          
ɸ
Bleaching controls. These may differ depending upon the type of bleaching device that 
you are using.
ɸ
Live Intensity plot. This live plot shows the mean intensity of ROIs (or the mean intensity 
of the whole image if no ROIs have been selected).  Prior to acquisition the mean intensity 
of all ROIs are shown in a single plot, during acquisition the mean intensity of each ROI is 
plotted individually. The Intensity plot is useful for assessing the level of photobleaching 
from the low intensity light source before acquisition, for adjusting the intensity of the high 
intensity light source, and for monitoring the progress of your experiment during 
acquisition.  Hide or show the live plot using the option in the FRAP menu.
ɸ
The Freeze button. This allows you to “freeze” the Preview when you find an area of 
interest. Any shutters associated with the current light path are closed to prevent 
photobleaching, but the last frame prior to closing the shutter is retained in the Preview. 
This allows you to select ROIs (bleaching areas) without illuminating your specimen, 
reducing photobleaching.
In the FRAP preview ROIs are used to mark regions that will be bleached during FRAP experiments.  
If your bleaching device supports spot bleaching bleaching regions may also be marked using the 
spot tool.
Preparing a FRAP Experiment
FRAP Acquisition is a plugin to Volocity Acquisition.  If you are not yet familiar with Volocity 
Acquisition we suggest that you consult that part of the guide first
These steps assume:
ɸ
that the bleaching device to be used is correctly configured and calibrated 
ɸ
that objectives are spatially calibrated
ɸ
that light paths to be used for bleach, pre-bleach and recovery wavelengths are configured
ɸ
and a FRAP acquisition protocol has been created.
Mount your specimen and expose it to your low intensity light source.
1. With your specimen in focus ensure that the all light is directed to your camera. You should see 
your specimen in the Video Preview. Adjust the camera controls until you are happy with your 
image.
Volocity Acquisition Installation and Reference
September 2011  168
2. You may wish to observe your specimen for a while to see whether you have an acceptable level 
of photobleaching from your low intensity light source, using the live intensity plot should help you 
make this judgment. If you make adjustments to your light intensity, remember to adjust your 
camera settings.
3. If possible, adjust the intensity of your bleaching device to the correct level. You should aim for 
maximum photobleaching without damaging or excessively heating your specimen.
4. When you are happy with the intensity of both your low intensity light source and bleaching device 
move to a new (unexposed) area of your specimen.
Ensure that the shutter management in the FRAP Acquisition protocol is set to any option other than 
“Don’t manage” and the shutter associated with the currently selected light path will be closed  while 
the preview is frozen protecting the sample from illumination light while still allowing bleaching areas 
to be drawn. See Creating a FRAP Acquisition Protocol.
5. With the FRAP Preview frozen you can set the bleaching area for your experiment without 
photobleaching your sample. ROIs are used to mark bleaching areas. Use any ROI tool to draw 
an ROI or restore an ROI by selecting ROI then Restore... from the Edit menu. To set an ROI of a 
particular size we recommend the use of the ROI stamp tool. For more information see “Drawing 
Regions Using ROI Tools” on page 264.
6. If your bleaching device supports spot bleaching you can use the Spot tool to add spot targets to 
the video preview.  You can add multiple spots by holding the SHIFT key whilst adding spots to 
the preview.  Each spot will be bleached sequentially.  Set the properties of spots (size, bleach 
duration etc.) using your bleaching device controls in the video preview.
Creating a FRAP Acquisition Protocol
1. Select Acquisition Setup... from the FRAP menu.
2. The FRAP Acquisition Setup dialog opens.
3. Select the bleaching device that you wish to use for the experiment from the Bleaching device to 
use drop down menu.
4. Select the light path that you wish to use for the bleaching phase of the experiment from the 
Bleaching device light path drop down menu.  
Select the Freeze button. The last frame previewed will be retained in the FRAP 
Preview. 
FRAP Acquisition
169    PerkinElmer          
5. If you wish to restore one or more light paths for your pre-bleach and recovery phases, select the 
Channels/Z tab and click on the  Change channels using light paths check box. If you wish to 
acquire more than one channel for these phases click on the “+” button to add more light paths. 
6. Select the appropriate light paths from the drop down menus. The same light paths will be used 
for both the pre-bleach and recovery phases of your acquisition.   Using a different light path for 
bleaching from that used for pre-bleach and recovery will delay the switch between imaging and 
bleaching and vice versa. 
7. In, Acquire pre-bleach images for, specify the duration and the frame rate of the pre-bleach 
period.
If it is not possible to determine the length of pre-bleach phase needed set this to a very long time 
period and use an acquisition rule to end the pre-bleach phase and trigger the bleach when an event 
occurs.  Rules are configured in the Rules tab, events may be time dependent, based on keystroke by 
the operator waiting for the optimal time or based on a device reaching a particular state.
8. In Acquire recovery images for, set the duration and frame rate of the recovery phase.  
You may wish to set a very high frame rate for initial recovery period, but slow down the acquisition as 
your recovery approaches plateau in order to reduce photobleaching of your specimen. This can be 
achieved by setting a number of recovery phases. 
To add an additional recovery phase click the “+” button. Set the duration and acquisition rate of the 
new phase. You may add up to six different recovery phases as to your protocol. To remove a 
recovery phase click on the “-“ button.
In the example shown above an initial recovery period of ten seconds in which images are acquired at 
maximum speed is followed by a sixty second phase in which images are acquired every four 
seconds, which is followed by a final recovery period of sixty seconds in which images are acquired 
every 10 seconds.
9. Set the Number of bleach/recovery cycles. This will usually be set to 1 for FRAP experiments. 
With the number of cycles set to 1 the protocol will finish after completing the recovery phases. 
You may wish to repeatedly bleach your specimen, for FLIP experiments for example. With the 
number of cycles set to greater than 1 the bleaching and all of the recovery phases will be 
repeated. Note: the pre-bleach phase is never repeated.
10. Select the Channels/Z tab.
ɸ
For conventional FRAP acquisition and analysis you should acquire only a single plane.  
Ensure that Change focus using is set to None.
Volocity Acquisition Installation and Reference
September 2011  170
11. Select a shutter management option from the Manage shutters for drop down menu.  This must 
be set to something other than Don’t Manage for the Freeze preview button to work correctly
12. When you are happy with your protocol click OK. 
13. Click on the “Capture” video control to apply the acquisition protocol that you have just set up.
Volocity will carry out the pre-bleach phase, fire the bleaching device according to its configuration 
and continue with acquisition of the recovery images.
When acquisition begins ROIs change to colored “Bleach areas”, the intensity within a “Bleach area” 
is plotted in a matching color on the live intensity plot. 
Documents you may be interested
Documents you may be interested