Image View
61    PerkinElmer          
Extended Focus
The Extended Focus mode displays a brightest point merge of all planes in the image.
Selections can be made within the volume, using the tools in the Image View toolbar, and 
measurements can be made from these selections. Note that the volume and all selections made are 
three-dimensional and have depth and volume. 
Pdf rearrange pages - re-order PDF pages in C#.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WinForms, WPF
Support Customizing Page Order of PDF Document in C# Project
how to rearrange pages in a pdf file; reorder pages in pdf file
Pdf rearrange pages - VB.NET PDF Page Move Library: re-order PDF pages in vb.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WinForms, WPF
Sort PDF Document Pages Using VB.NET Demo Code
move pages in a pdf; pdf reorder pages
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September 2011  62
Z Planes
The 3D image viewed as individual z planes.  Channels are overlaid.  The Z Planes does not support 
tiled channels.
Channel Controls
In an image view the controls for working with the individual channels in a dataset are shown to the 
right.  If these are not visible select Image menu, Show Channels.
ɸ
Turn channels on and off by clicking on the show/hide channel button
ɸ
Target channels using the “Target” button.  Some tools make different selections 
depending on which channel is used as the basis for selection. For example, the magic 
wand tool works on voxel intensity so the size and shape of the selection made by the tool 
can be very different according to which channel is targeted when the selection is drawn.  
ɸ
Increase or decrease the contribution of individual channels to the final image, using the 
slider bar for the channel.  This will make the channel appear brighter or darker in relation 
to the others.
Channel Controls for Reference Channels
When a single-plane reference channel is present in a 3D image the different nature of the channel is 
indicated by the text (reference) in the channel name. In addition to the controls for the channels 
C# TIFF: How to Reorder, Rearrange & Sort TIFF Pages Using C# Code
C# TIFF - Sort TIFF File Pages Order in C#.NET. Reorder, Rearrange and Sort TIFF Document Pages in C#.NET Application. C# TIFF Page Sorting Overview.
reordering pdf pages; rearrange pages in pdf online
VB.NET TIFF: Modify TIFF File by Adding, Deleting & Sort TIFF
you want to change or rearrange current TIFF &ltsummary> ''' Sort TIFF document pages in designed powerful & profession imaging controls, PDF document, image
move pages in pdf document; reordering pages in pdf document
Image View
63    PerkinElmer          
above the reference channel has an opacity slider to control the opacity of the reference image in the 
3D planes part of the Image view only.
Time Navigation
If the image sequence contains more than one timepoint  the time navigation controls will be enabled. 
Move through time resolved data in an image view using the time navigation controls across the 
bottom of the view.  If these controls are not visible select Show Time Navigation from the Image 
view.
Play the sequence back at a fixed rate (number of frames per second set by the slider) or real time (for 
example 10x acquisition rate, again set by the slider).
Set the mode of playback by selecting Loop Sequence or Shuttle Sequence from the Image menu. 
If, because of the size of the data or capabilities of the hardware each timepoint cannot be loaded at 
the rate specified by the slider Skip Timepoints will miss out timepoints as necessary to maintain the 
frame rate.
Image Toolbar 
Mode
Select the display mode for the image data.  Modes available will 
depend on the dimensions available in the data.  2D data can only 
be shown as an XY Plane.  3D data may be shown as XYZ Planes, 
and any part of the XYZ Planes view independently.  Other modes 
may be available with additional products such as Volocity 
Visualization.
Tile Channels
Select the display of channels within the image.  Channels are 
overlaid or tiled as individual channels plus the overlay.  Not all 
modes of the Image view support tiled channels.  In these modes 
the tiled option is grayed out.
VB.NET PDF File & Page Process Library SDK for vb.net, ASP.NET
page directly. Moreover, when you get a PDF document which is out of order, you need to rearrange the PDF document pages. In these
change pdf page order online; how to reorder pages in pdf preview
Online Merge PDF files. Best free online merge PDF tool.
the button below and download your PDF. The perfect conversion tool. By dragging your pages in the editor area you can rearrange them or delete single pages.
how to move pages within a pdf document; change pdf page order online
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September 2011  64
Inspection Tool 
Note on the screen how the cross-hair colors are different for each plane and are also shown on the 
3D preview in the top left-hand corner. 
Zoom and Pan Tools
Selection Tools 
Use the Selection tools to draw regions of interest (ROIs) and lines on the image. Although the tools 
are available with all versions of Volocity, they are mainly used for measuring with Volocity 
Shortcut key I
Use the cross-hair tool to position the pointer on any of the planes 
and drag to explore the Image view moving through the different 
parts of the slices. The cross-hairs will be labelled with the current 
X,Y,Z coordinates. The Inspection tool also operates in XY, YZ 
and XZ modes, moving in two axes simultaneously to explore the 
data.
The keyboard page up and page down keys can also be used to 
move up or down plane by plane in a 3D dataset when in an Image 
view mode that supports the inspection tool.
Shortcut key Z
Image views show zoom to fit behaviour. When the window 
containing the view is made larger or smaller the image will be 
scaled accordingly. Use the zoom tool to zoom in by multiples of 
the original size. Click with the tool to zoom in. On a Mac, Alt-click 
zooms out again. On a PC, use Ctrl-click. When the zoom tool is 
active an overlay on the image shows the percentage zoom. 
Double click on the zoom tool icon to restore zoom to fit behaviour.
Shortcut key H
On 2D Image and Movie Views, use the Hand tool to pan through 
a magnified image. On 3D Image Views, use the Hand tool to pan 
the XYZ planes. Over the 3D cross-section the cursor will always 
appear as a hand. Click and hold, then spin and release to make 
the preview tumble. Use Alt-click (Mac) or Ctrl-click (WINDOWS) 
and drag to zoom the 3D cross-section. 
XZ, green
YZ, blue
C# PowerPoint - How to Process PowerPoint
pages simply with a few lines of C# code. C# Codes to Sort Slides Order. If you want to use a very easy PPT slide dealing solution to sort and rearrange
switch page order pdf; reorder pages in pdf preview
VB.NET Word: How to Process MS Word in VB.NET Library in .NET
well programmed Word pages sorter to rearrange Word pages in extracting single or multiple Word pages at one & profession imaging controls, PDF document, image
move pages in pdf acrobat; reorder pages pdf
Image View
65    PerkinElmer          
Quantitation. Refer also to the chapter on "Volocity Quantitation" for worked examples using these 
tools for measurements.
Tips on Using the Selection Tools
Once you have selected an area, you can also use the Copy command from the Edit menu. Cut, 
Paste and Clear commands are only active if the item is adopted 
As long as the selection is still active, you can use the pointer to click in the selected area and drag it 
to another part of the image. 
The following key combinations also apply: 
Macintosh
ɸ
Control-drag on a selection centers the selection on the image. 
ɸ
Command-drag locks the dimensions, to make a square or circular selection rather than 
oblong or oval.
ɸ
Shift allows you to add to the ROI or draw multiple ROIs.
ɸ
Shift + alt (option) allows you to subtract from the ROI or subtract the whole of the existing 
ROI by drawing around it. 
Shortcut key R
The Rectangular ROI selection tool is available for all image data. 
It allows you to draw rectangles or squares. 
Shortcut key S
The Lasso tool allows you to trace the outline of a selection. The 
Lasso tool selects regions based upon the color similarities of 
adjacent pixels. The initial point clicked sets the color to compare 
and the tool has the effect of shrinking around the pixels that fall 
outside of the tolerance value. 
Shortcut key C
The Elliptical ROI selection tool allows you to draw ovals or 
circles. 
Shortcut key F
The Freehand tool is available for all image data. It allows you to 
make a freehand selection of an area on the image. 
Shortcut key W
The Magic Wand tool is available for all image data. It allows you 
to select regions based upon the color similarities of adjacent 
pixels. The initial point clicked sets the color to compare. This tool 
has the effect of expanding outwards from the original color.  
The Line tool is available for all image data, but is of limited use 
without the Volocity Quantitation functionality. Use it to add lines in 
the Image View. The tool draws a straight line between points that 
you specify by holding down the Shift key and clicking with the 
cursor. Line length and an intensity profile overlay are shown on 
the image if set in the view options. You can have any number of 
points in a single draw action, as long as you hold down the Shift 
key. When you release the Shift key, Volocity assumes that the 
last click was the end point.  Click on the points within a line to 
move or delete.
Use the Point tool to count objects or features visible in the image.
VB.NET PowerPoint: Sort and Reorder PowerPoint Slides by Using VB.
page will teach you to rearrange and readjust amount of robust PPT slides/pages editing methods and powerful & profession imaging controls, PDF document, image
reverse page order pdf online; change page order pdf
Process Images in Web Image Viewer | Online Tutorials
used document types are supported, including PDF, multi-page easy to process image and file pages with the deleting a thumbnail, and you can rearrange the file
move pdf pages online; move pages in pdf file
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September 2011  66
ɸ
Alt (option) carries out an AND operation leaving only the intersection of the two ROIs. 
Windows
ɸ
Shift allows you to add to the ROI or draw multiple ROIs. 
ɸ
Shift + ctrl allows you to subtract from the ROI or subtract the whole of the existing ROI by 
drawing around it. 
ɸ
Ctrl carries out an AND operation leaving only the intersection of the two ROIs. 
ROI Options
The ROI is shown as marching ants on the Image View with color projected onto the image to 
highlight the area of interest. You can define the color and transparency used for the ROI. 
1. Select View Options... from the Image menu. Click the ROI tab.
2. Use the ROI color drop-down menu to select the required color and use the slider control to set 
the ROI opacity. 
Marching ants outline 
the ROI
Color block shows 
projection of ROI on 
each plane
Image View
67    PerkinElmer          
3. Click on OK.
Image Menu 
Whenever an Image View is active, there is an Image menu available in the menu bar. The menu 
commands are appropriate to the type of image data. For example, some options are only shown for 
3D images.
Mode sets the visualization for the view. The same options are available in a pop-up on the tool bar 
and change the way that the image is displayed. For example a 3D image can be visualized as planes 
in XZ, YZ and XY or just one of these at a time. Volocity Visualization adds options to this list.
Stereo is only applicable for an image being viewed in 3D rendering and therefore discussed in the 
section on Volocity Visualization.
Show/Hide Channels, Bookmarks, Movie and Time Navigation will change the panels of the 
Image view that are visible.
Display sub menu selects items that can be shown as part of the image; scale, color reference, 
timestamps etc.  Use the Smooth Zoom command to apply interpolation to the view to give better 
quality when viewing zoomed images and automatically set the best quality for printing.  Use Always 
Show Crosshairs to turn on an overlay of the positional information shown by the inspection tool.
A description and more information on Capture Snapshot can be found at “Capture Snapshot 
Command (View-Specific menu) ” on page 82, Create QTVR is available with Volocity Visualization 
only, for more information see  “Capture Snapshot ” on page229 .  These are both for creating output 
from the Image View that may be shared with other people.
Loop Sequence, Shuttle Sequence and Skip Timepoints select the playback mode for time 
resolved data.  Use the Time Navigation controls to start and stop playback.
Next in the menu come a series of options which will apply overlays to the image or change elements 
of the view.  These are not permanent changes and the menu item will change to the opposite to allow 
any change to be reversed.
Reset View will return the view to its default appearance.
If an image timestamp has been displayed using Show Time Absolute Times or Relative Times will 
affect the format the timestamp is shown in.
When viewing the image view of an image sequence consisting of two or more channels, the user can 
choose the method that is used to merge the two channels for display from the Overlay channels 
using sub menu. 
ɸ
Brightest point: The brightest intensity in the source images is displayed. 
ɸ
Accumulate: The total intensity of the voxels in the source images is displayed. 
ɸ
Average: The average intensity of the source images is displayed. 
Show Time
The timestamp of an image in an image sequence can be shown when viewing the Image View. 
ɸ
Select Image menu, Display, Show Time or Hide Time to toggle the timestamp on or off.
ɸ
Select Absolute Times or Relative Times to choose the style of timestamp to be 
displayed. 
ɸ
Select Image menu, View Options... On the General tab use Frame time color to change 
the color of the timestamp. 
Views on Data
September 2011  68
Showing Color Reference
On all Image Views, apart from millions of colors images, you can display a legend that shows the 
colors in the image and the values they represent. 
To display this legend, select Display Show Color Reference from the Image menu. 
The color reference may be moved to any corner of the XY area of the image view.
Note: There is a separate color reference for each visible channel. Therefore, if multiple channels are 
shown in the channel controls, multiple legends will be displayed. Hide unwanted color references by 
hiding the channels from which they are derived on the channel controls
Select Image menu, View Options... and the Color Reference tab choose how the color reference is 
displayed.
Image View
69    PerkinElmer          
Showing Scale on Images
Whenever an Image View is active, you will also be able to display scaling information. Select Image 
menu, Display,Show Scale. 
ɸ
The scale displayed will depend on the properties set for the size of voxels in the X,Y and 
Z dimensions. Choose Properties... from the Edit menu to check these values and ensure 
the correct scale is displayed.
ɸ
Use View Options... and the Scale tab from the Image menu to change how scale is 
displayed.
ɸ
Move the scale to any of the four corners of the image by dragging it.
ɸ
Extend or shorten the scale bar by clicking and dragging one end of it.
Showing Line Profile on Images
Draw a line across the image to show an overlay displaying the intensities along that line.  A different 
overlay is added for each line drawn and the intensities for different channels are shown in the 
respective colors of the channels.
The colored band at the top of each profile reflects the color of the line.  Note that the line may be 
positioned anywhere in 3D space using the XYZ mode of the Image view.
If the line profile is not visible turn it on in the General tab of the View Options dialog.
Use View Options... 
Scale tab to show/hide 
labels 
Views on Data
September 2011  70
Capture snapshot will create a snapshot with the currently active line profiles captured to the right of 
the image.
Reference channels are ignored by the line profile tool. Intensity profiles will only be available for the 
3D channel(s) in a dataset containing reference channel(s)/
View Options
The View Options... dialog is available in the Image menu.  This is a tabbed dialog with options for:
ɸ
General: showing the length of lines drawn using the line tool, showing the line profile and 
the color of image timestamps shown on the Image view
ɸ
Color Reference: to change the nature of the color reference overlay, its orientation, color 
and caption
ɸ
Scale: to change the style, color and labeling of the scale bar overlay
ɸ
ROI: to change the appearance of ROIs in the image view
Bookmarks
Bookmarks record information about the position and appearance of the data in the Image view 
allowing a way of viewing image data to be reproduced and compared.
Bookmarks do not store zoom level of the image, the status of overlays on the image such as time or 
scale,nor will they store and therefore turn on or off any measurement feedback that maybe shown in 
a view when the bookmark is made.
Bookmarks are stored in a panel to the left of the image data.  If this panel is not already visible select 
Image menu, Show Bookmarks.  When the view appears as required select Image menu, Add 
Bookmark.  Settings controlled by the channel controls or the tools for positioning items will be stored 
in the bookmark.  Overlays turned on or off by items in the Image menu e.g. scale and time are not 
stored by bookmarks. 
To Use a Bookmark
1. Double click on the thumbnail of a bookmark in the bookmark pane to use the settings of that 
bookmark to change the position and appearance of the Image view to those stored by the 
bookmark.  Alternatively use Next Bookmark or Previous Bookmark in the Image menu to step 
through bookmarks in the order in which they were created.
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