Application Test in Western Kenya 
____________________________________________________________________________ 
A Protocol for Measuring and Monitoring Soil Carbon Stocks in Agricultural Landscapes 
34 
(b) 
Depth
(cm)
Soil mass (g) 
Pdf find and replace text - search text inside PDF file in C#.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WinForms, WPF
Learn how to search text in PDF document and obtain text content and location information
search a pdf file for text; pdf text search tool
Pdf find and replace text - VB.NET PDF Text Search Library: search text inside PDF file in vb.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WinForms, WPF
Learn How to Search Text in PDF Document and Obtain Text Content and Location Information in VB.NET application
how to select text on pdf; text select tool pdf
Application Test in Western Kenya 
____________________________________________________________________________ 
A Protocol for Measuring and Monitoring Soil Carbon Stocks in Agricultural Landscapes 
35 
Figure 8.5 (a) SOC stocks, (b) soil mass, and (c) soil carbon concentration in the five 
sentinel sites in western Kenya. 
The mean SOC in the topsoil (0-20 cm) of the 5 sentinel sites is 21.53
1.75 t ha
-1 
(Table 
8.1).  The  largest  and  smallest  SOC  stocks  were  found  in  Mid  Nyando  and  lower  Yala, 
respectively.  
(C) 
Depth
(cm)
Carbon concentration (g kg
-1
VB.NET PDF replace text library: replace text in PDF content in vb
and ASP.NET webpage. Find and replace text in PDF file in preview without adobe PDF reader component installed. Able to pull text
find text in pdf image; how to select text in a pdf
VB.NET PDF File Merge Library: Merge, append PDF files in vb.net
When you have downloaded the RasterEdge Image SDK for .NET, you can unzip the package to find the RasterEdge.Imaging.PDF.dll in the bin folder under the root
search pdf files for text; how to search a pdf document for text
Application Test in Western Kenya 
____________________________________________________________________________ 
A Protocol for Measuring and Monitoring Soil Carbon Stocks in Agricultural Landscapes 
36 
Table 8.1 Soil organic carbon stock (Mean 
SE) in the five sentinel sites, western 
Kenya  
Site 
SOC stock (t ha
-1
0-20 cm 
0-120 cm 
Lower Nzoia 
16.09 
1.82 
94.54 
8.01 
Mid Yala 
18.54 
5.70 
62.80 
12.82 
Lower Yala 
15.29 
1.84 
56.02 
10.89 
Mid Nyando 
36.82 
6.49 
168.99 
41.22 
Lower Nyando 
28.18 
5.92 
134.15 
31.17 
8.2.4 
Determining landscape level SOC stocks 
The models developed based on the reflectance values of the visible and near infrared bands of 
QuickBird imagery (Figure 8.7) are robust in estimating SOC stocks. The efficiency of the 
models can be improved by adding additional data sources such as topographic data.  
Figure 8.6 Model performance of QuickBird to estimate SOC stock in the topsoil (0-20 
cm) 
A similar approach can be used to estimate SOC stock at a landscape scale using 
medium  resolution  imagery  such  as  ASTER  and  Landsat.  The  detail  methods  used  in 
estimating SOC using reflectance values is presented in Appendix 2. 
The landscape level SOC stock was estimated using the visible and near infrared 
reflectance values of QuickBird imagery (Figure 8.8). The effect of cloud is masked as no data.  
VB.NET PDF File & Page Process Library SDK for vb.net, ASP.NET
document. If you find certain page in your PDF document is unnecessary, you may want to delete this page directly. Moreover, when
how to search text in pdf document; pdf find highlighted text
VB.NET Create PDF Library SDK to convert PDF from other file
Create writable PDF file from text (.txt) file in VB.NET project. you can download the RasterEdge .NET Image SDK and find the PDF processing component DLL
pdf search and replace text; pdf searchable text
Application Test in Western Kenya 
____________________________________________________________________________ 
A Protocol for Measuring and Monitoring Soil Carbon Stocks in Agricultural Landscapes 
37 
Figure 8.7 Soil organic carbon stocks in the mid Yala, western Kenya 
C# HTML5 PDF Viewer SDK deployment on Visual Studio .NET
Unzip the download package and you can find a project XDoc.PDF.HTML5 Viewer Demo or XDoc.PDF.HTML5 Editor Once done debugging with x86 dlls, replace the x86
pdf text select tool; converting pdf to searchable text format
VB.NET PDF - Deploy VB.NET HTML5 PDF Viewer on Visual Studio.NET
to How to Build Online VB.NET PDF Viewer in Unzip the download package and you can find a project named XDoc Once done debugging with x86 dlls, replace the x86
text searchable pdf; how to search pdf files for text
38 
REFERENCES 
Africa  Soil  Information  Service.  2010.  Location  of  Sentinel  Landscapes  [Online] 
http://www.africasoils.net/ (verified 10 November 2010). 
Amundson, R. 2001. The carbon budget in soils. Ann. Rev. Earth Planet. Sci. 29:535-562. 
Amundson, R., and Jenny, H. 1997. On a state factor model of ecosystems. Bioscience 47:536-
543. 
Batjes, N.H. 2001.  Options for Increasing Carbon Sequestration in West African Soils: An 
Exploratory Study with Special Focus on Senegal. Land Degradation and Development 
12:131-142. 
Batjes, N.H., and Dijkshoorn, J.A. 1998. Carbon and Nitrogen Stocks in the Soils of the Amazon 
Region. Geoderma 89:273-286. 
Boscolo, M., Powell, M., Delaney, M., Brown, S., and Faris, R. 2000. The Cost of Inventorying 
and Monitoring Carbon: Lessons from the Noel Kempff Climate Action Project. Journal 
of Forestry 98(9):24-31. 
Braun-Blanquet, J. 1928. Pflanzensoziologie. Gru¨  ndzuge der Vegetationskunde  Springer-
Verlag, Berlin. 
Brown, D., Shepherd, K.D., and Walsh, M.G. 2006. Global soil characterization using a VNIR 
diffuse reflectance library and boosted regression trees. Geoderma 132:273-290. 
Campbell, B.M. 2009. Beyond Copenhagen: REDD+, adaptation strategies and poverty. Global 
Environmental Change 19:397-399. 
CyberTracker. 2010. [Online] http://www.cybertracker.co.za/ (verified 10 November 2010). 
Dewis, J., and F. Freitas. 1970. Physical and Chemical Methods of Soil and Water Analysis 
FAO, Rome. 
Di  Gregorio,  A.,  and  Jansen,  L.J.M.  1998.  Land  Cover  Classification  System  (LCCS): 
Classification Concepts and User Manual. Environment and Natural Resources Service, 
GCP/RAF/287/ITA Africover - East Africa Project and Soil Resources, Management and 
Conservation Service. FAO, Rome. 
Ellis, J., and Larsen, K. 2008. Measurement, Reporting and Verification of Mitigation Actions 
and Commitments. OECD/IEA, Paris. 
Fransen, T., McMahon, H., and Nakhooda, S. 2008. Measuring the Way to a New Global 
Climate Agreement. World Resources  Institute Discussion Paper, World Resources 
Institute, Washington, DC. 
Freese,  F.  1984.  Statistics  for  land  managers:  an  introduction  to  sampling  methods  and 
statistical analysis for foresters, farmers and environmental biologists Paeony Press. 
Ge, X.H., Zhao, Y.L., Zhang, F.Q., Zhang, L., Yao, S.X., and Qin, Y. 2007. Effect of cancer cells 
on the spectra of serums. Spectroscopy and Spectral analysis 24(7):841-843. 
Harris, D.,  Horwath, W.R., and van  Kessel,  C.  2001.  Acid  fumigation  of  soils  to remove 
carbonates prior to total organic carbon or carbon13 isotopic analysis. Soil Science 
Society of America Journal 63:1853-1856. 
IPCC.  2003.  Good  Practice  Guidance  for  Land  Use,  Land-Use  Change  and  Forestry, In 
Penman, J., et al., eds. Institute for Global Environmental Strategies (IGES), Japan. 
ITC. 2001. ILWIS 3.0 Academic User’s Guide. Enschede, The Netherlands.
Lal, R., Kimble, J.M., Follett, R.F., and Stewart, B.A., (eds.) 2001. Assessment Methods for Soil 
Carbon, pp. 1-676. CRC/Lewis Press, Boca Raton, FL. 
Lee, J., Wopmans, J.W., Rolston, D.E., Baer, S.G., and Six, J. 2009. Determining soil carbon 
stock  changes:  Simple  bulk  density  corrections  fail.  Agriculture.  Ecosystems  and 
Environment 134:251-256. 
MacDicken, K.G. 1997. A Guide to Monitoring Carbon Storage in Forestry and Agroforestry 
Projects. Winrock International, Arlington, Virginia. 
Malley, D.F., Martin, P.D., and Ben-Dor, E. 2004. Application in analysis of soils, In  Barbarick, 
K. A., et  al., eds.  Near-infrared spectroscopy in agriculture. Agronomy Monograph, 
Crop, Science Society of America, Soil Science Society of America, Madison,  pp 729
784. 
Martens, H., and Naes, T. 1989. Multivariate Calibration John Wiley & Sons, Chichester, UK. 
C# PDF File Permission Library: add, remove, update PDF file
Text: Replace Text in PDF. Image: Insert Image to PDF. Image: Remove Image from using RasterEdge.XDoc.PDF; In the following code table, you will find a piece of
find and replace text in pdf; find text in pdf files
VB.NET PDF File Permission Library: add, remove, update PDF file
to PDF. Text: Delete Text from PDF. Text: Replace Text in PDF. In the following code table, you will find a VB NET code sample for how to set PDF file permissions
pdf select text; select text in pdf file
39 
Martens, H., and Martens, M. 2001. Multivariate Analysis of  Quality.  An Introduction. J. Wiley & 
Sons, Ltd. 
Naes, T., Isaksson, T., Fearn, T., and Davies, T. 2002. A user-friendly guide to multivariate 
calibration and classification, NIR Publications, Chichester, UK. 
Pearson, T., Walker, S., and Brown, S. 2005. Sourcebook for land Use, land-use change and 
forestry projects. BioCarbon Fund and  Winrock International. 
Pearson, T.R.H., Brown, S. , and Birdsey R.A. Measurement Guidelines for sequestration of 
forest carbon. USDA forest service, Delware. 
Pinheiro, J.C., and Bates, D.M. 2000. Mixed-effects models in S and S-PLUS Springer, New 
York. 
R Development Core Team. 2008. R: A Language and Environment for Statistical Computing. R 
Foundation for Statistical Computing, Vienna. 
Shepherd,  K.D.,  and Walsh,  M.G.  2002.  Development  of  reflectance  spectral  libraries  for 
characterization of soil properties. Soil Science Society of America Journal 66:988-998. 
Shepherd, K.D., and Walsh, M.G. 2004. Diffuse reflectance spectroscopy for rapid soil analysis, 
In Lal, R., ed. Encyclopedia of Soil Science. Marcel Dekker Inc., New York. 
Shepherd, K.D., and Walsh, M.G. 2007. Infrared spectroscopy-enabling  an evidence-based 
diagnostic  surveillance  approach  to agricultural  and  environmental  management  in 
developing countries. Journal of Near Infrared Spectroscopy 15:1-19. 
Skjemstad, J., and Baldock, J.A. 2008. Total and organic carbon, p. 225-238, In  Carter, M. R. 
and Gregorich, E. G., eds. Soil sampling and methods of analysis. Soil Science Society 
of Canada. 
UNFCCC. 2006. Approved afforestation and reforestation baselines methodology AR-AM0002: 
"Restoration of degraded lands through afforestation/reforestation".  
United 
Nations. 
2007. 
Bali 
Action 
Plan: 
Decision 
1/CP.13. 
[Online] 
http://unfccc.int/documentation/decisions/items/3597.php?such=j&volltext=/CP.13#beg 
(verified 05 August, 2010). 
Vagen, T.-G., Shepherd, K.D., and Walsh, M.G. 2006. Sensing lanscape level change in soil 
quality following deforestation and conversion in the highlands of Madagascar using 
Vis-NIR spectroscopy. Geoderma 133:281-294. 
Viscarra Rossel, R.A. 1997. Robust modelling of soil diffuse reflectance spectra by ''bagging 
partial least squares regression''. Journal of Near Infrared Spectroscopy 15:39-47. 
Viscarra Rossel, R.A. 2008. ParLeS: Software for chemometric analysis of spectroscopic data. 
Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems 90:72-83. 
Viscarra Rossel, R.A., and Lark, R.M. 2009. Improved analysis and modelling of soil diffuse 
reflectance spectra using wavelets. European Journal of Soil Science 60(3):453
464. 
Wang, D.-D., Shi, X.-Z., Wagner, H.-J., Wendorf, D.C., Yu, D.-S., Sun, W.-X., Ren, H.-Y., and 
Zhao, Y.-C. 2010. Scale Effect of Climate and Soil Texture on Soil Organic Carbon in 
the Uplands of Northeast China. Pedosphere 20(4):525-535  
Webster, R.,  and Burgess,  T.M.  1984. Sampling and  bulking strategies for estimating soil 
properties in small regions. Soil Sci 35:127-!40. 
Young, A. 2000. Land Resources: Now and for the Future Cambridge University Press, UK. 
40 
10 
APPENDIX 1  FIELD DATA COLLECTION FORM 
The LSDF field data collection format (Figure 1) can be used for soil carbon measuring and 
monitoring projects. 
Figure 1 Field data gathering form 
41 
11 
APPENDIX 2   SPATIAL  MODELING  OF  SOC  USING 
REMOTELY SENSED DATA 
Mapping SOC stocks using QuickBird imagery 
The spatial The QuickBird high-resolution satellite was launched in 2001. QuickBird acquires 
data  in  panchromatic and  multispectral bands  with spatial resolutions  of  0.61 and  2.4  m, 
respectively (Table 1). 
Table 1 QuickBird panchromatic and multispectral data spectral bandwidth 
Product 
Band 
Spectral Range 
Panchromatic 
Black and White 
445 
900 nm 
Multispectral 
Blue 
450 
520 nm 
Green 
520 
600 nm 
Red 
630 
690 nm 
Near-Infrared 
760 
900 nm 
The pixel size of the images should be aggregated to fit to the plot size (Figure 2). 
Figure 2 Simplified schematic diagrams showing the prediction of SOC using remote 
The  remote  sensing  data  was  analysed  using  the  Integrated  Land  and  Water 
Systems  (ILWIS)  remote  sensing  and  GIS  software.  ILWIS  is  a  freeware,  which  can  be 
42 
downloaded  from http://www.itc.nl/ilwis/downloads/ilwis33.asp. The  remote  sensing  analysis 
can be also done in other GIS software’s.
The plot size is 1000 m
2
and while the Quickbird imagery has a spatial resolution of 
about 2.4 m. Thus, it is important to aggregate the plot size so that it matches the plot size 
(Figure 3).  
Right mouse click to the image to be aggregated Raster Operations-Aggregate 
Map 
Type a value for the size of the blocks of input pixels on which an aggregation 
function should be applied (14, which approximates 1000 m
2
Select an aggregation function: Median 
Select this check box if each block of input pixels should appear as one pixel in the 
output map after the aggregation.  
Figure 3 Aggregation of pixels in ILWIS 
Extracting reflectance values from images  
The attribute table should have the coordinates (x, y) of each plot centre. The attribute table 
should be imported into a GIS environment using the following step:  
Save the table in DBF4 or ASCII format 
Go to ILWIS-Import-Table-choose the file- select ILWIS import
43 
The reflectance/DN value for each plot can be extracted and stored into the attribute table using 
the mapvlaue command in ILWIS (ITC, 2001) (Figure 4). The map value uses the coordinates 
of the plot to extract the reflectance/DN values from each band.  
Output column = mapvalue(image,coord(x,y)) 
Figure 4 Extracting reflectance values into an attribute table 
Export the table to .txt format for further statistical analyses in R 
Go to File (main ILWIS Window) -export-select the table-select .txt format from the dropdown 
menu  
Documents you may be interested
Documents you may be interested