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QE Pro Scientific
-
grade Spectrometer
Installation and Operation Manual
For Products: QE Pro 
Document: 891-00000-000-02-201603 
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on an “as is” basis. Ocean Optics, Inc. shall have neither liability nor responsibility to any person or entity with respect 
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891-00000-000-02-201603 
i 
Table of Contents 
About This Manual ......................................................................................................... iii
Document Purpose and Intended Audience .............................................................................. iii
Document Summary .................................................................................................................. iii
Product-Related Documentation ............................................................................................... iii
Upgrades ....................................................................................................................... iv
Warranty ........................................................................................................................ iv
ISO Certification ............................................................................................................ iv
Compliance ................................................................................................................... iv
Chapter 1: Introduction ..................................................................... 1 
Product Overview .......................................................................................................... 1
Models ........................................................................................................................... 2
Features ........................................................................................................................ 2
System Requirements ................................................................................................... 3
EEPROM Utilization .................................................................................................................. 4
About Ocean Optics Software ................................................................................................... 4
Sampling System Overview....................................................................................................... 4
How Sampling Works ............................................................................................................ 4
Modular Sampling Accessories ............................................................................................. 4
Interface Options ........................................................................................................... 4
Shipment Components .................................................................................................. 5
Other Accessories Available .......................................................................................... 6
Breakout Box ............................................................................................................................. 6
Chapter 2: Installing the QE Pro ....................................................... 7 
Overview ....................................................................................................................... 7
QE Pro Installation ......................................................................................................... 7
USB Mode ................................................................................................................................. 7
QE Pro Spectrometer Device Driver Installation ....................................................................... 8
Installing the Driver Software for QE Pro Spectrometers on Windows 7 (32 and 64-bit) ..... 8
Installing the Driver Software for QE Pro Spectrometers on on Windows XP (32 and 64-bit)
.............................................................................................................................................. 10
Serial Port Mode ........................................................................................................................ 12
LED Operation ........................................................................................................................... 12
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Table of Contents 
ii 
891-00000-000-02-201603 
Configuring the QE Pro.................................................................................................. 13
Configuring QE Pro in OceanView ............................................................................................ 13
OceanView QE Pro Acquisition Controls .............................................................................. 14
Connect Spectroscopic Accessories .............................................................................. 18
External Triggering Options ........................................................................................... 18
Change the Slit .............................................................................................................. 18
Chapter 3: Troubleshooting .............................................................. 20 
Overview ....................................................................................................................... 20
QE Pro Connected to Computer Prior to Software Installation ....................................... 20
Windows Operating Systems .................................................................................................... 20
Remove the Unknown Device from Windows Device Manager ........................................... 20
Apple Mac OSX Operating Systems ......................................................................................... 21
Linux Operating Systems .......................................................................................................... 21
Appendix A: Calibrating the Wavelength of the QE Pro ................. 22 
Overview ....................................................................................................................... 22
About Wavelength Calibration ....................................................................................... 22
Calibrating the Spectrometer ......................................................................................... 23
Preparing for Calibration ............................................................................................................ 23
Calibrating the Wavelength of the Spectrometer ...................................................................... 23
Saving the New Calibration Coefficients: USB Mode ..................................................... 25
Appendix B: Specifications ............................................................... 27 
Overview ....................................................................................................................... 27
How the QE Pro Works.................................................................................................. 27
QE Pro Components Table ....................................................................................................... 28
QE Pro Specifications .................................................................................................... 29
CCD Detector Specifications ..................................................................................................... 29
QE Pro Spectrometer Specifications ......................................................................................... 29
System Compatibility ..................................................................................................... 30
30-Pin Accessory Connector Pinout .............................................................................. 31
30-Pin Accessory Connector Pinout Diagram ........................................................................... 31
30-Pin Accessory Connector 
Pin Definitions and Descriptions .............................................. 31
30-Pin J2 Accessory Connector - Part Numbers....................................................................... 33
HR4-CBL-DB15 Accessory Cable Pinout ...................................................................... 33
Index ................................................................................................... 35
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891-00000-000-02-201603 
iii 
About This Manual   
Document Purpose and Intended Audience 
This document provides the user of the QE Pro Spectrometer with instructions for setting up, calibrating 
and performing experiments with their spectrometer. 
What’s New in this Document 
This version of the QE Pro Scientific-grade Spectrometer, Installation and Operation Manual updates 
information about the optional shutter.  
Document Summary 
Chapter 
Description 
Chapter 1: 
Introduction
Contains descriptive information about the QE Pro Spectrometer and 
how sampling works. It also provides a list of system requirements, 
interface options, and shipment components. 
Chapter 2: Installing the QE Pro 
Provides installation and configuration instructions. 
Chapter 3: 
Troubleshooting
Contains recommended steps to isolate and correct common 
problems. 
Appendix A:Calibrating the 
Wavelength of the QE Pro  
Provides instructions for calibrating the QE Pro Spectrometer. 
Appendix B: 
Specifications
Contains technical specifications and connector pinouts for the QE 
Pro Spectrometer. 
Product-Related Documentation 
You can access documentation for Ocean Optics products by visiting our website at 
http://www.oceanoptics.com. Select Support 
Technical Documents, then choose the appropriate 
document from the available drop-down lists.    
Document for… 
Document Location 
OceanView software http://oceanoptics.com/wp-content/uploads/OceanViewIO.pdf 
HR-4 Breakout Box 
http://oceanoptics.com/wp-content/uploads/HR-4-Breakout-Box.pdf 
External triggering 
http://oceanoptics.com/wp-content/uploads/External-Triggering-
Options_Firmware3.0andAbove.pdf 
Device driver issues 
http://oceanoptics.com/wp-content/uploads/Correcting-Device-Driver-Issues.pdf 
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library also makes PDF document visible and searchable on the Internet by converting PDF document file to Use C#.NET Demo Code to Convert PDF Document to
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About This Manual 
iv 
891-00000-000-02-201603 
Ocean Optics offers a Glossary of spectroscopy terms to help you further understand your state-of-the-art 
products and how they function, located at: http://oceanoptics.com/glossary/. 
Upgrades  
Occasionally, you may find that you need Ocean Optics to make a change or an upgrade to your system. 
To facilitate these changes, you must first contact Customer Support and obtain a Return Merchandise 
Authorization (RMA) number. Please contact Ocean Optics for specific instructions when returning a 
product. 
Warranty  
Our 3-Year Warranty covers Ocean Optics miniature fiber optic spectrometers, light sources and 
sampling accessories 
regardless of the application 
from manufacturing defects. It also covers fibers 
and probes for a full 12 months: http://oceanoptics.com/services/exclusive-3-year-warranty/. 
This comprehensive warranty ensures you of the highest level of craftsmanship and reliability for years to 
come. No other manufacturer offers such a solid guarantee of quality and reliability. 
The Ocean Optics 3-Year Warranty applies to Ocean Optics equipment (excluding OEM configurations) 
purchased on or after July 1, 2010. The warranty covers parts and labor needed to repair manufacturing 
defects that occur during the warranty period. We also will cover the costs of shipping warranty-related 
repairs from our customers to Ocean Optics and from us to our customers. 
ISO Certification 
Ocean Optics, the industry leader in miniature photonics, has been certified for ISO 9001:2008 
certification applicable to the design and manufacture of electro-optical equipment since 2009. 
Compliance 
WARNING 
This is a Class A product. In a domestic environment this product may cause radio 
interference in which case the user may be required to take adequate measures. 
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C# HTML5 Viewer: Load, View, Convert, Annotate and Edit Word
C# users can convert Convert Microsoft Office Word to searchable PDF online, create multi to add annotations to Word, such as add text annotations to
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3: Troubleshooting 
891-00000-000-02-201603 
FCC COMPLIANCE 
This equipment has been tested and found to comply with the limits for a Class A 
digital device, pursuant to Part 15 of the FCC Rules. These limits are designed to 
provide reasonable protection against harmful interference when the equipment is 
operated in a commercial environment. This equipment generates, uses and can 
radiate radio frequency energy and, if not installed and used in accordance with the 
instruction manual, may cause harmful interference to radio communications. 
Operation of this equipment in a residential area is likely to cause harmful 
interference in which the user will be required to correct the interference at his on 
expense. 
WARNING: The authority to operate this equipment is conditioned by the 
requirement that no modifications will be made to the equipment unless the changes 
or modifications are expressly approved by the manufacturer. 
891-00000-000-02-201603 
1 
Chapter 1   
Introduction 
Product Overview 
The Ocean Optics QE Pro  Spectrometer is a scientific-grade spectrometer that is ideal for researchers and 
industrial customers. Its broadband sensitivity, from UV to NIR, makes it suitable for a wide range of 
applications, while its high sensitivity and thermo electric cooler enable effective measurements at very 
low light levels. The QE Pro  also has the highest dynamic range of any fiber optic CCD spectrometer in 
its class.  
Two LEDs are provided to monitor spectrometer and TEC operation. The QE Pro  operates from power 
provided from a separate +5VDC power supply. 
Ocean Optics QE Pro High-Sensitivity Fiber Optic Spectrometer 
The QE Pro  features a Hamamatsu low-etaloning, back-thinned FFT-CCD detector with a 2-D 
arrangement of pixels (1044 horizontal x 64 vertical) that is responsive from 200-1100 nm and has a peak 
quantum efficiency of ~90% (with a QE of 65% at 250 nm)
. The detector’s columns are binned, or 
summed, inside the detector prior to the readout process, thereby minimizing readout noise. Additionally, 
the detector can be cooled from 40°C below ambient up to 50°C with the onboard TE-Cooler to reduce 
dark noise. The reduction of noise and dark signal allows integration times of the spectrometer (analogous 
to the shutter speed of a camera) of up to 60 minutes, which greatly enhances the detection limit in low-
light level applications. The back-illuminated detector has enhanced response in the UV. The inherent UV 
response eliminates the need for UV-sensitive detector coatings that can be difficult to apply consistently 
from batch to batch.  
The combination of the spectrometer’s low
-noise detector and 18-bit A/D Converter delivers a dynamic 
typical range of ~85,000:1 and a signal-to-noise ratio of 1000:1 (at full signal). 
Replaceable slits are offered for added convenience. Deep UV option includes purge port. 
1: Introduction 
2 
891-00000-000-02-201603 
The QE Pro
’s onboard module has 10 user
-programmable digital I/O lines for interfacing to other 
equipment; and a pulse generator for triggering other devices. You can use the I/Os to flash a lamp, 
stop/start a process, and send a message/alarm during the spectrometer’s integration period. The 
spectrometer’s operating parameters can be 
controlled through software. In fact, wavelength calibration 
coefficients unique to each spectrometer are programmed into a memory chip right on the spectrometer.  
The QE Pro
’s high
-speed electronics have been designed for considerable flexibility in connecting to 
various modules and external interfaces, including PCs, PLCs and other embedded controllers, through 
USB 2.0 or RS-232 communications.  
A +5 VDC external power supply is required to operate the spectrometer. This power supply is included 
with your spectrometer. 
An optional internal shutter is available on custom-configured spectrometers (INTERNAL-SHUTTER-
LRG-BENCH). This makes it easier to take dark measurements and when you need fast integration times 
with the best possible signal. This optional feature is also recommended for probe-based or emissive 
measurements where it is difficult to introduce a shutter into the optical path. The shutter can be added to 
an existing QE Pro for an extra charge. 
Models 
The QE Pro is custom configurable for your specific application. In addition, the following preconfigured 
models are offered: 
QE Pro-ABS   
For absorbance, reflection, irradiance and transmission measurements with a 
wavelength range of 200 
950 nm 
QE Pro-FL  
For fluorescence measurements with a wavelength range of 350 
1100 nm 
QE Pro-Raman 
for 785 nm Raman analysis with a wavelength range of 780 
1100 nm (preset 
for 785 Raman) 
Features 
Hamamatsu S7031-1006S Detector: 
Typical dynamic range ~85,000:1 
Peak QE: 90% 
Back-thinned for enhanced UV sensitivity 
Integration times from 8 ms to 60 minutes 
TE Cooled 
Scientific-grade Optical Bench: 
Symmetrical Crossed Czerny Turner 
101mm focal length 
F number : f/4 
Interchangeable slits 
14 gratings (H1 
H14); HC1 
6 slit widths, plus no slit in SMA or FC bulkhead 
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