how to view pdf in c# : Extract vector image from pdf Library SDK component asp.net wpf web page mvc 1000294024-part132

Chapter 11. Differential Displays and VNTRs
11-3
Trends
Select the Trend button to search for increasing or decreasing levels of gene 
expression across samples, represented by trends in normalized quantity across lanes. 
With Trend selected, a linear regression of (n
q
) versus lane number is computed for 
each band type. The leftmost and rightmost lanes containing that band type are 
determined. The normalized quantities for these lanes are calculated from the 
regression model. If:
abs(leftmost_n
q
– rightmost_n
q
) >
difference and
Max(leftmost_n
q
, rightmost_n
q
) / Min(leftmost_n
q
, rightmost_n
q
) >
ratio
then the band type is flagged as a trend. 
Displaying Results
Bands identified as outliers or belonging to a trend are highlighted with a white line 
in the image.
If a lane is missing a band assigned to a band type that is flagged as an outlier or a 
trend, the expected location of the band will be highlighted by a white box.
Use the Normalized Quantity button in the Differential Display dialog to display a 
histogram of the normalized quantities and the mean quantity for a band type. Click 
on the button, then click on the band. A graph will display the normalized quantities 
of that band across the entire gel.
11.2Variable Number Tandem Repeats
If your experiments involve the use of microsatellites, VNTRs, or other repeated 
elements, you can calculate the number of times a repeated element occurs in a band. 
Note:
You must define the Standards in the gel before you can use this function (see 
section 6.1, Standards).
To calculate the VNTRs in the bands in a gel, select VNTR Calculations from the 
Analysis menu. (You can also select the VNTR Quick Guide from the Help menu for 
guidance on analyzing gels with VNTRs.)
Extract vector image from pdf - Select, copy, paste PDF images in C#.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WinForms, WPF
Support PDF Image Extraction from a Page, a Region on a Page, and PDF Document
some pdf image extract; how to extract pictures from pdf files
Extract vector image from pdf - VB.NET PDF Image Extract Library: Select, copy, paste PDF images in vb.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WinForms, WPF
Support PDF Image Extraction from a Page, a Region on a Page, and PDF Document
pdf image extractor online; extract jpg pdf
Quantity One User Guide
11-4
The Tandem Repeat Calculations dialog box will open.
Fig. 11-2. Tandem Repeat Calculations dialog box.
At the top of the dialog box is the equation used to calculate the number of times an 
element is repeated in a band. 
The band size is determined by the position of the band on the gel image. 
In the Flanking Region Size field, enter the size (in base pairs or other repeated 
units) of the part of the fragment that does not include any repeated elements. This 
would include primer length and the length of any sequences that fall between the end 
of the primer region and the beginning of the stretch of repeats.
VB.NET PDF Convert to SVG SDK: Convert PDF to SVG files in vb.net
NET PDF file & pages edit, C#.NET PDF pages extract, copy, paste use the PDF conversion control to render and convert PDF document to SVG vector image in VB
extract jpg from pdf; extract photo from pdf
C# PDF remove image library: remove, delete images from PDF in C#.
PDF to text, VB.NET extract PDF pages, VB Support removing vector image, graphic picture, digital photo, scanned Get all image objects and remove multiple or
extract photos from pdf; extract images from pdf c#
Chapter 11. Differential Displays and VNTRs
11-5
Fig. 11-3. Diagram of components of a DNA fragment.
In the Repeated Unit Size field, enter the size in base pairs of the repeated element 
(e.g., if you are working with (CA) repeats, enter “2”).
Testing for Ambiguity
The number of repeats calculated by the software may not be a whole number, due to 
the limitations of exact band size determination. Since the number of times an 
element is repeated must be a whole number, the calculated value is rounded to the 
nearest whole number.
In the dialog box, you have the option to “flag” those numbers 
Select Yes after Test for ambiguity? to flag values that deviate from the nearest 
whole number by a certain fraction. These values may warrant further review. In the 
Ambiguous if rounded > field, specify how much the calculated value must deviate 
from the nearest whole number for it to be flagged.
Finally, specify how to identify the ambiguous values using the Flag with * button or 
the Leave Blank button.
When you have entered all the information in the dialog box, click on the Done 
button. The number of tandem repeats will be displayed next to the bands. (Note that 
if no standards have been defined on the gel, no numbers will be displayed.)
If the numbers have been concealed (e.g., by the Hide Overlays command), you can 
redisplay them by selecting VNTR Display.
PCR Primer
Sequence between primer and VNTR
VNTR repeat unit
VB.NET PDF remove image library: remove, delete images from PDF in
edit, C#.NET PDF pages extract, copy, paste Support removing vector image, graphic picture, digital photo, scanned Remove multiple or all image objects from PDF
extract images from pdf acrobat; how to extract a picture from a pdf
C# PDF copy, paste image Library: copy, paste, cut PDF images in
copy, paste and cut vector image, graphic picture new PDFDocument(inputFilePath); // Extract all images PDFImageHandler.DeleteImage(doc, image); } // Output the
extract images from pdf; extract images from pdf files without using copy and paste
Quantity One User Guide
11-6
VB.NET PDF Convert to Images SDK: Convert PDF to png, gif images
In addition, our PDF document conversion library also enables developers to render and convert PDF document to TIFF and vector image SVG.
extract photos pdf; extract pdf pages to jpg
VB.NET PDF copy, paste image library: copy, paste, cut PDF images
to copy, paste and cut vector image, graphic picture New PDFDocument(inputFilePath) ' Extract all images PDFImageHandler.DeleteImage(doc, image) Next ' Output
extract images pdf; pdf image extractor
12-1
12.Reports
Quantity One can display and print a variety of analysis reports. You can format the 
reports to include different kinds of data.
The available reports are listed under the Reports menu.
Fig. 12-1. Reports Menu.
12.1 Report Window
Many of the reports share the same basic report window.
C# PDF Convert to SVG SDK: Convert PDF to SVG files in C#.net, ASP
it is quite necessary to convert PDF document into SVG image format. Here is a brief introduction to SVG image. SVG, short for scalable vector graphics, is a
extract images from pdf file; extract vector image from pdf
C# PDF insert image Library: insert images into PDF in C#.net, ASP
other bitmap images. Powerful .NET PDF image edit control, enable users to insert vector images to PDF file. Import graphic picture
how to extract text from pdf image file; extract text from image pdf file
Quantity One User Guide
12-2
Fig. 12-2. Example of a report window.
The standard report window has buttons for printing the report, scrolling through the 
screen pages of the report, and exporting the report to a spreadsheet application. Some 
report windows also have a Reformat button for changing the data display.
To close a report window, click on the Close box in the upper right corner of the 
window.
Print One Page Print All Pages
Export Reformat
Controls for scrolling
through screen pages
Click here to close the report window
VB.NET PowerPoint: PPTX to SVG Conversion; Render PPT to Vector
is listed to render PPTX to vector image file in converted and rendered into svg image format while powerful & profession imaging controls, PDF document, tiff
how to extract images from pdf in acrobat; extract image from pdf acrobat
Chapter 12. Reports
12-3
Scrolling
If a report has multiple pages, the scroll buttons in the report window become active. 
Use them to scroll to the next page, previous page, first page, or last page of the 
report. You can also enter a specific page number in the field to skip to that page.
Printing
Print the report using the Print One Page or Print All Pages commands in the report 
window.
Click on either of these buttons to open a smaller version of the standard print dialog 
(described in the next chapter).
Fig. 12-3. Print Report dialog.
Print One Page prints only the current screen page. Print All Pages prints all the 
pages in the report.
Windows version:
Macintosh version:
Quantity One User Guide
12-4
Note:
If you select Print All Pages, the number of pages printed may be less than the 
number of screen pages listed in the report window. This is because the print 
command reformats the data to make maximum use of the paper size.
Exporting Report Data
You can export the report data to a spreadsheet application for further computation 
and analysis.
Click on the Export button to open the Export Report dialog.
Fig. 12-4. Export Report dialog.
Exported data can be separated by commas or tabs, depending on the requirements of 
your spreadsheet application.
You can save the data to a text file or to the clipboard by selecting the appropriate 
option button. If you select File, when you click on OK a dialog will open in which 
you can save the file.
Reformatting Report Data
Click on the Reformat button to open the options dialog for the report and select 
different display options. This button is not available in all reports.
Chapter 12. Reports
12-5
12.2 Lane and Match Reports
There are four different lane and match reports: Lane Report, All Lanes Report
Match Report, and All Matches Report.
Lane Report generates a report on any you lane you select. First select the report 
from the Reports menu, then click on the particular lane.
All Lanes Report generates a report on all the lanes in the current gel image.
Match Report generates a report on a matched band that you select. First select the 
report from the menu, then click on a matched band. This report requires band 
matching (see section 6.2, Band Matching).
All Matches Report generates a report on all the matched bands in the gel . This 
report requires band matching (see section 6.2, Band Matching).
When you select any of these reports, the Report Options dialog will open, where you 
can specify the type and formatting of the data.
Fig. 12-5. Report Options dialog.
Quantity One User Guide
12-6
Select the data to display using the checkboxes.
Select the Font Size, Column Spacing, and Line Spacing settings to be used in the 
report by clicking on the button next to each field and selecting from the list of 
options.
To save the report options, click on the Modify Report Settings button and enter a 
name for the report settings in the field.
To load or delete previously saved settings, click on the button next to the Settings to 
Load or Delete field and select from the list of saved settings. Then click on Load or 
Delete.
To display the report, click on the Report button. The report will be displayed in a 
standard report window (see section 12.1, Report Window).
12.3 Band Types Report
The Band Types Report shows the presence or absence of specific bands in specific 
lanes of a gel. The report window displays a schematic representation of all the bands 
and lanes in the gel, with the presence or absence of bands shown as specified in the 
options dialog.
Documents you may be interested
Documents you may be interested