itextsharp c# view pdf : Extract photos pdf Library application component .net html winforms mvc DIVA-GIS_manual_75-part1439

DIVA-GIS 7 
45 
number of observations 
minimum distance between two points of each class (MinD) 
maximum distance between two points of each class (MaxD) 
average distance between two points of each class (AverageD) 
Distances are expressed in meters. For correct calculations, you must specify whether 
the shapefile is in decimal degrees or projected (with meters as unit). The output is 
written to a DBF file. 
The same calculation can be done for all points (i.e. without distinguishing among 
classes), and a complete distance matrix will be the produced 
(Analysis/Distance/Matrix). 
6.8
Autocorrelation 
Spatial autocorrelation exists when the values of nearby geographical objects are more 
similar than those of objects that are further away. For example, an altitude grid has 
a high spatial autocorrelation. The Autocorrelation option in DIVA-GIS calculates this 
relationship by using two common statistics, the Geary and Moran indices, the values 
of which may be interpreted as in Table 7. You can calculate the autocorrelation on a 
grid or a points shapefile. The spatial autocorrelation functionality implemented in 
DIVA-GIS is based on the “Rookcase” software by Sawada (1999). 
Table 5. Autocorrelation statistics. 
Geary 
Moran 
Interpretation 
0 < c < 1 
c = 1 
c > 1 
i > 0 
i = 0 
i < 0 
Autocorrelation exists, data are clustered 
Independent, at random 
Negative autocorrelation 
6.8.1
For points 
When calculating autocorrelation for points, and you need to define which neighboring 
points to consider. This is done by specifying the lag (or neighborhood) distance. Only 
points within the lag distance are considered for calculation. 
Extract photos pdf - Select, copy, paste PDF images in C#.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WinForms, WPF
Support PDF Image Extraction from a Page, a Region on a Page, and PDF Document
extract pictures from pdf; extract text from image pdf file
Extract photos pdf - VB.NET PDF Image Extract Library: Select, copy, paste PDF images in vb.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WinForms, WPF
Support PDF Image Extraction from a Page, a Region on a Page, and PDF Document
extract pictures pdf; extract photos from pdf
DIVA-GIS 7 
46 
To determine a reasonable lag distance, a number of statistics are shown in the 
Options tab of the Analysis/Autocorrelation/Points  window. These statistics include 
the number of observations (points) and statistics describing the distances among all 
pairs of points (min, max, mean, median and first and third quartile).  
You must select a quantitative field from the shapefile‟s database to calculate 
autocorrelation. After selecting a field you can deselect individual values that you 
want to exclude. If you do that you need to recalculate the statistics, which will have 
changed, because you do no longer consider all points. The results will appear on 
clicking “Apply” 
Figure 11. Autocorrelation/Point window (Options, left and Results, right) 
6.8.2
For gridcells 
No lag distance needs to be specified to calculate autocorrelation of grids. Only 
adjacent cells are considered, either 4 horizontally and vertically adjacent cells 
(”Rook‟s case”), or also including the 4 diagonally adjacent cells (”King‟s case”). 
VB Imaging - VB ISSN Barcode Generating
help VB.NET developers draw and add standard ISSN barcode on photos, images and BMP image formats, our users can even create ISSN barcode on PDF, TIFF, Excel
extract vector image from pdf; some pdf image extract
C# Image: How to Add Antique & Vintage Effect to Image, Photo
Among those antique things, old photos, which can be seen everywhere, can are dedicated to provide powerful & profession imaging controls, PDF document, tiff
pdf image extractor online; extract image from pdf file
DIVA-GIS 7 
47 
6.9
Histogram 
With the Histogram option your grid data are arranged in classes. The program offers 
you some common tools to improve the histogram (titles, show grid, etc.) and the 
result can be copied to the clipboard. 
6.10
Regression 
With the Regression tool, you can regress one grid against another (cell by cell) and 
plot the results. Choose one gridfile for X and another for Y, making sure that the grid 
extents and resolutions coincide. You can use linear, logarithmic, or exponential 
regression. For multiple regression and more advance statistical methods, it is 
convenient to use the R program (with raster package). 
6.11
Multiple Regression 
You can regress one grid against several others using the Multiple regression tool. If 
you find a satisfactory (statistically significant) model, you can use it to predict values 
for the same area, or for another area (by changing the independent variables).  
VB.NET TWAIN: Scanning Multiple Pages into PDF & TIFF File Using
enterprises or institutions, there are often a large number of photos or documents be combined into one convenient multi-page document file, like PDF and TIFF.
pdf image text extractor; pdf extract images
VB.NET Image: Program for Creating Thumbnail from Documents and
developers to create thumbnail from multiple document and image formats, such as PDF, TIFF, GIF As we all know, photos and graphics take up a lot of server space
how to extract a picture from a pdf; how to extract text from pdf image file
DIVA-GIS 7 
48 
7.
T
HE 
M
ODELING MENU
The Modeling menu provides various options for niche modeling, or the prediction of 
species distribution patterns (Box 8). 
Box 8. Functions in the Modeling menu 
Icon  Sect.  Name 
Short explanation 
7.1 
Bioclim / Domain  Runs the BIOCLIM and DOMAIN models for predicting 
the presence of species 
7.2 
External Models 
Uses other models to predict the presence of species 
7.3 
Evaluation 
7.5 
EcoCrop 
Predicts the adaptation of a crop for a selected area 
7.6 
Terrain Modeling  Creates grids of aspect or slope from an elevation 
grid 
7.1
Bioclim / Domain  
With the Bioclim / Domain tool you can extract data from the climate database for 
point locations (in the active points shapefile), make graphs of these data and use the 
extracted data for predictive niche modeling using the BIOCLIM (Busby, 1991; Nix, 
1986) and the DOMAIN (Carpenter et al., 1993) approach.  
You can only open this window when a points shapefile is the active layer on your 
Table of Contents.  There are six tabs in this window: 
7.1.1
Input 
Here you can choose to run a model with the standard climate data (DIVA climate 
data) or with a stack of layers of your choosing.  
You can also choose to consider all points as one class or distinguish different classes 
(e.g., species) by selecting an appropriate field. Duplicate points (with exactly the 
same coordinates and species) are removed from the analysis. You can choose whether 
VB.NET Image: Image and Doc Windows, Web & Mobile Viewers of
Users can directly browse and process images and photos on your computer. & image files of this mobile viewer are JPEG, PNG, BMP, GIF, TIFF, PDF, Word and DICOM
extract image from pdf c#; extract image from pdf online
VB.NET Image: Barcode Reader SDK, Read Intelligent Mail from Image
and recognize Intelligent Mail barcode from scanned (or not) photos and documents in How to combine PDF Document Processing DLL with Barcode Reading control to
extract images from pdf files without using copy and paste; some pdf image extractor
DIVA-GIS 7 
49 
you want to also remove points that fall within the same grid cell (this is 
recommended).  
7.1.2
Frequency 
You can make cumulative frequency distribution plots for various climatic variables, 
for up to two classes (e.g., species), which are shown in different colors on the graph. 
This can be very useful in spotting outliers, which may be due to errors in the data. 
Click on a point on the graph (for the second class only) to see where the 
corresponding locality is on the map, and display attribute and/or climate data for 
that point. You can show percentiles and the 1.5 inter-quartile range (IQR; points 
within this range are not considered outliers) on the graphs, and change the size of 
the dots. You can save the graph to the clipboard with the “Copy” button at the top 
left hand corner (and then paste it into a document or presentation) and counts of the 
number of observations per class to a TXT file (“Save Stats” button in the bottom right 
hand corner). 
7.1.3
Outliers 
Here you can look for outliers in environmental space. You can include 1 to n variables 
in the evaluation (n being the number of variables in your stack; if you use DIVA-GIS 
climate files n =19). Suspect records are colored red (as opposed to black). You can 
click on a line on the graph to see where the corresponding locality is on the map, and 
display attribute and/or climate data for that point. 
7.1.4
Histogram 
Another way to explore the climate data for a points shapefile is to make histograms. 
Select a class, a variable and either an appropriate bar width or number of bars. You 
can restrict the minimum and maximum values to be shown. As usual, you can save the 
histogram to the clipboard. 
7.1.5
Envelope 
In this menu, you must choose a class (e.g., species) and two climatic variables. On 
pressing the “Apply” button, a graph will be drawn in which each point on the graph 
VB.NET Image: VB Code to Read Linear Identcode Within RasterEdge .
Support reading and scanning Identcode from scanned documents and photos in VB code; and recognize multiple Identcode barcodes form single or multiple PDF page(s
extract images from pdf files; extract image from pdf in
VB.NET Image: VB Code to Download and Save Image from Web URL
view and store thousands of their favorite images and photos to Windows We are dedicated to provide powerful & profession imaging controls, PDF document, image
extract images from pdf; extract vector image from pdf
DIVA-GIS 7 
50 
represents the climate of a point on the map, each axis representing one of the 
climate variable that you chose.  
You can set a percentile value to find out which are the extreme observations in terms 
of climate. The percentile is used to exclude the extreme values of all climate 
variables. A box is drawn on the graph to indicate, for the two climate variables 
selected, which points are within, and which points are outside the climatic 
“envelope” defined by the specified percentiles. These points will be different for 
each pair of variables.  
The points that fall within the envelopes for all the climate variables are colored 
green on the graph. The points that fall outside one or more envelopes are shown in 
red. All the points inside the two-dimensional envelope shown on the graph are 
”selected” (highlighted in yellow) on the map. You can of course save the graph to the 
clipboard in the usual way. The “Extract” button saves a TXT file with the average 
values of each bioclimatic variable for each class. 
7.1.6
Predict 
This is the business end of this menu. The extracted climate data can be used to 
predict where a species is likely to occur, or would survive if it was brought there (this 
could be on a different continent, for example).  
To select an area for mapping, you can enter the coordinates manually, or use “Draw 
rectangle”, or you can press the “Read from layer” button, and the dimensions of the 
active layer will be copied. These may need to be adjusted a little to coincide with 
those of the climate database. This is done automatically, but you can also do it by 
pressing the “Adjust” button.  
You can select the climate variables you want to use in the analysis. The fewer 
variables you select, the larger the predicted areas of suitability will be. You can also 
choose either the current climate or the future climate. 
If you selected “Many classes” on the Input tab, you can use the “Batch” option under 
Predict to run the model for all different classes (typically species). Or you can select 
a single class and run the model for that only. 
C# Imaging - Scan RM4SCC Barcode in C#.NET
PDF, Word, Excel and PPT) and extract barcode value Load an image or a document(PDF, TIFF, Word, Excel barcode from (scanned) images, pictures & photos that are
extract pdf pages to jpg; pdf extract images
VB.NET Image: Image Resizer Control SDK to Resize Picture & Photo
daily life, if you want to send some image files or photos to someone We are dedicated to provide powerful & profession imaging controls, PDF document, image
pdf image extractor; some pdf image extract
DIVA-GIS 7 
51 
You must select an output grid. You have a choice of six different output variables for 
this grid:  
Bioclim - Four types of areas are mapped. Areas completely outside the 0-100 
percentile envelope for one or more climate variables get a code “0”. The cells within 
the 5-95 percentile get a code “3”, those outside this range but within the 2.5-97.5 
percentile get a code “2”, and the ones outside this but within the 0 -100 percentile 
for all climate variables get a code “1”. 
Bioclim True/False – All areas that are within the envelope described by the data 
points, cut off beyond a certain user defined percentile, are mapped as “true” (1); all 
other areas are mapped as “false” (0).  
Bioclim Most Limiting Factor – For the cells that fall within the 0-100 percentile, the 
variable for which the percentile score was lowest (or highest) is mapped. The value in 
each grid square is a number that corresponds to the variables on the Predict tab. 
Domain - The Domain procedure calculates the Gower distance statistic between each 
cell on the map and each point, using the values of the 19 climate variables. The 
distance between point A and grid cell B for a single climate variable is calculated as 
the absolute difference in the values of that variable divided by the range of the 
variable across all points. The Gower distance is then the mean over all climate 
variables.  
p
k
k
k
AB
k
range
B
A
p
d
1
( )
|
|
1
The Domain similarity statistic is calculated as  
AB
d
D
 
1
The maximum similarity between a grid cell and all points is mapped. In DIVA, this 
value is then multiplied by 100.  A good match is thus a high number (e.g., above 95). 
Domain (Mean Distance) - This is the same as above, but the mean distance to all 
points is used instead of the minimum distance.  
DIVA-GIS 7 
52 
Domain True/False - All areas that are within the specified threshold are mapped as 
“true” (1); all other areas are mapped as “false” (0).  
Domain Most Limiting Factor - The variable with the lowest score (largest distance) is 
mapped. The value in each grid square is a number that corresponds to the variables 
on the Predict tab.  
7.2
External Models  
With this module you can export points from a shapefile to prepare input files for 
”external” distribution models, i.e. ones not supported directly by DIVA-GIS. In some 
cases, such as for MAXENT and GARP, this is in fact not very difficult, because they 
just use a list of species with coordinates. However, for programs that need a site by 
species matrix (such as GRASP), the preparation of input files is far from trivial. For 
GRASP, 3 files are made (YYY, XXX, and XXXpred).  
Some models will produce grids in a format that DIVA can import via the Data / Import 
to Gridfile menu. GRASP, however, produces LookUp Tables, or LUT files, that can be 
imported in this module. You must select the LUTs you want, together with the stack 
that was used to make the input files (or another, but compatible, stack, if you study 
climate change).  
7.3
Evaluation 
Using this menu you can evaluate the performance of a niche model. It is a three step 
process, as described below, a sub-menu for each step. 
7.3.1 Prepare points 
This tool allows you to split point distribution data into a number of subsets that you 
can use to test a distribution model. You can specify what percentage of the points 
you want to use to “train” (i.e., run) the model (as a percentage of the total number 
of points: “Sample size training data (%)”), and how many separate times you want to 
do the sampling (“# Repetitions”). You can also sample the background environment 
to create “pseudo-absence” points (“Include Random Absence Data”). The output is 
DIVA-GIS 7 
53 
two shapefiles of points, the name of one ending with “_train” (the model training 
data, and the other with “_test” (the model testing data). Use the training data to run 
a model (see previous sections in this chapter), and the test data to evaluate the 
models (see below), using the “class” (e.g., species) field and the “presence/absence” 
field.  
7.3.2 Create Evaluation File 
Use a “_test” shapefile from the process described above to create a ROC file. You 
must provide a shapefile that has a “presence / absence” field. The field name does 
not matter, but the contents must be words that start with a “p” or with an  “a” e.g., 
“pres” and “abs”. A ROC file is a text file with values extracted for each species (grid) 
for the absence and the presence points. You can calculate kappa and ROC statistics 
with these (see below).  
7.3.1
Show ROC / Kappa 
You can visualize the results of model testing here. The input file is the ROC file 
generated above. You can asses the quality of a prediction by inspecting the ROC 
curve and you can find the optimal threshold for presence/absence by inspecting the 
kappa/threshold plot. 
The area under the ROC (Receiver Operating 
Characteristic) curve is commonly used to evaluate models in species 
distributional modeling.
A ROC curve is created by plotting the true-positive 
fraction against the false-positive fraction for all test points across all possible 
probability thresholds (Fielding and Bell 1997). The curve goes from (0,0) to 
(1,1) and a model that produces a curve with a high true-positive fraction at 
low values of the false-positive fraction is considered good. This is commonly 
quantified by calculating the area under the curve (AUC).
AUC ranges from 0 to 
1 where a value of 0.5 indicates that a model is no better than random and a 
value of 1 indicates that the model can discriminate perfectly between 
presence and absence records.
DIVA-GIS 7 
54 
7.4
EcoCrop  
This module uses FAO‟s EcoCrop database of the environmental requirements of a long 
list of plant species, whichcan be used to identify possible crops to grow in a 
particular environment. In DIVA-GIS, we implement EcoCrop to predict the adaptation 
of a crop over geographic areas. Currently, only temperature and precipitation data 
are used to make this prediction.  
In EcoCrop, the growing period is defined in days between Gmin and Gmax (start of 
growth and end of growth, respectively). The length of the growing season is defined 
as the average of Gmin and Gmax. 
In DIVA-GIS, 12 possible growing seasons are considered, starting on the first of each 
month. To determine the suitability of a growing season for a certain crop, the 
following temperature parameters are used: 
KTMP: absolute temperature that will kill the plant 
TMIN: minimum average temperature at which the plant will grow 
TOPMN: minimum average temperature at which the plant will grow 
optimally 
TOPMX: maximum average temperature at which the plant will grow 
optimally 
TMAX: maximum average temperature at which the plant will cease to 
grow 
The suitability of a location (grid cell) for a crop is evaluated for each of the 12 
potential growing seasons. If the average minimum temperature in one of these 
months is 4 C or less above KTMP, it is assumed that, on average, KTMP will be 
reached on one day of the month, and the crop will die. The temperature suitability of 
that month is thus 0%. If this is not the case, the temperature suitability is evaluated 
for that month using the other temperature parameters. See the example for maize in 
Figure 12 for how this is done. The overall temperature suitability of a grid cell for a 
crop, for any growing season, is the lowest suitability score for any of the consecutive 
number of months needed to complete the growing season. 
Documents you may be interested
Documents you may be interested