I-1
Appendix I
VersaDoc
Fig.I-1. VersaDoc.
Before you can acquire images using the VersaDoc or VersaDoc MP Imaging System, 
you need to install the Roper Scientific interface adapter and its associated device 
drivers in your  computer. The driver installation procedures for Windows operating 
systems inlcude pre-installation and use of the Windows Hardware Wizards. 
Note:
Important! Please read and follow the driver installation procedures contained in 
the README documents before you install the VersaDoc camera interface 
adapter.  You can find the README documents in the VersaDoc Drivers folders 
on The Discovery Series (TDS) CD. 
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I-2
The CD also contains Roper Scientific camera interface driver installation 
instructions for Macintosh computers. 
See the VersaDoc hardware manual for further installation, startup, and operating 
instructions for the VersaDoc Imaging System.
The VersaDoc Imaging System contains white and UV flourescent bulbs, whereas the 
VersaDoc MP contains blue and white LEDs and optional red and green LEDs.  
I.1 VersaDoc Acquisition Window
To acquire images using the VersaDoc,  go to the File menu and select VersaDoc.... 
The acquisition window for the instrument will open, The acquisition window opens, 
displaying a control panel and an image display window.
Fig.I-2. VersaDoc acquisition window.
When the VersaDoc window first opens, no image will be displayed.
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Appendix I. VersaDoc
I-3
The control panel has been arranged from top to bottom to guide you through the 
acquisition procedure. There are four basic steps to acquiring an image using the 
VersaDoc:
1. Select the application.
2. Position and focus the object to be imaged.
3. Set the exposure time.
4. Acquire the image.
I.2 Step I. Select Application
In Step 1, you select the appropriate filters and other imaging parameters for the type 
of gel, blot, plate, or other object that you are imaging. Each set of parameters you 
select is called an application.
The VersaDoc supports multichannel sequential imaging. This allows you to 
automatically image the same object using up to four different applications (e.g., to 
detect different types of stains on the same gel).
First you select a channel, then you select the application under that channel.
I.2.a. Selecting a Channel
Note:
Illumination Flat Fielding will be disabled if you use multiple channels.
The four channels are accessed using the tabs under Step 1. Channel 1 is always 
enabled—that is, the VersaDoc will always capture an image using the application 
settings selected under Channel 1 first.
To enable any of the remaining channels, click on a channel tab, then select the 
Enable Channel checkbox and select the application for that channel as described 
below.
Enabled channels have a green check mark on their tabs.
Note:
If you use the Optimize Exposure feature, only the application under the selected 
channel tab will be imaged; other channels, even if enabled, will be ignored.
C# HTML5 Viewer: Load, View, Convert, Annotate and Edit Raster
C#.NET RasterEdge HTML5 Viewer supports convert images to Tiff (.tif, .tiff) online, create PDF document from images. Raster Images Annotation.
extract jpeg from pdf; pdf image extractor c#
VB.NET PDF- View PDF Online with VB.NET HTML5 PDF Viewer
PDF to text, C#.NET convert PDF to images, C#.NET file & pages edit, C#.NET PDF pages extract, copy, paste C#.NET read barcodes from PDF, C#.NET OCR scan PDF.
extract text from pdf image; extract jpg from pdf
Quantity One User Guide
I-4
You do not need to enable Channels 2–4 in sequence. For example, you can set up 
your four most common applications using the different channels, but only enable 
Channel 4 for a particular gel. Channel 1 would be scanned first, Channel 4 second.
Enabled channels are imaged sequentially. The separate scans are displayed and saved 
as separate images. The total imaging time depends on the number and type of 
enabled applications.
If you have selected Auto Save After Scan, the image created using Channel 1 will 
have the base file name, and images created using subsequent channels will have the 
base file name plus a version number. (v. 2, v. 3, v. 4). Note that the image version 
number does not necessarily correspond to the channel number. For example, if you 
captured an image using only Channels 1 and 4, the image created using Channel 4 
will be saved as version 2 (v. 2).
I.2.b. Selecting an Application
To select an application (i.e., the appropriate filter and illumination source for the type 
of object you are imaging), click on the Select button under a channel tab.
Standard Applications
The standard applications and associated settings are listed in a tree that expands from 
left to right. When you select an application, the software automatically sets the 
appropriate filter in the VersaDoc for that particular application. The VersaDoc has 
four application groups, and the VersaDoc MP has six application groups. 
First select your general application, then select the particular stain or medium you 
are using. When you select the stain or medium, the software automatically sets the 
appropriate filter (520LP, 530DF60, 610LP, clear, or none), light type (UV, white, or 
none), and light source (Trans, Epi, or neither) in the VersaDoc for that particular 
application.
VB.NET PDF Page Extract Library: copy, paste, cut PDF pages in vb.
Use corresponding namespaces; using RasterEdge.Imaging.Basic; using RasterEdge.XDoc.PDF; VB.NET: Extract All Images from PDF Document.
extract pictures from pdf; how to extract images from pdf file
C# HTML5 PDF Viewer SDK to view PDF document online in C#.NET
Form Process. Data: Read, Extract Field Data. Data: Auto Redact Text Content. Redact Images. Redact Pages. Annotation & Add Text Box. Drawing Markups. PDF Print.
extract photo from pdf; how to extract text from pdf image file
Appendix I. VersaDoc
I-5
Fig.I-3. The application tree in the VersaDoc acquisition window.
Note:
If you select an application that requires trans white illumination, you will need 
to place the white light conversion screen on the sample stage area.
To exit the tree without selecting, press the Esc key or click outside the dialog box.
Your selection will be displayed below the Select button.
Custom Applications
If your application is not listed, if you want to use a user-installed filter, or if you want 
to set the gain and bin settings manually, you can create and save your own custom 
applications.
From the application tree, select Custom, then Create. This will open a dialog box in 
which you can name your application and select your settings.
VB.NET PDF - Convert PDF Online with VB.NET HTML5 PDF Viewer
NET read PDF, VB.NET convert PDF to text, VB.NET extract PDF pages, VB Able to set scaling value of converted images. VB.NET HTML5 PDF Viewer: Convert PDF Online.
extract photos from pdf; extract image from pdf
VB.NET PDF - Create PDF Online with VB.NET HTML5 PDF Viewer
PDF to text, C#.NET convert PDF to images, C#.NET file & pages edit, C#.NET PDF pages extract, copy, paste C#.NET read barcodes from PDF, C#.NET OCR scan PDF.
extract images from pdf file; some pdf image extract
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Fig.I-4. Creating a new custom application.
Enter a name for your application in the Name field.
Next, click on the buttons next to the Filter, Illumination, Gain and Binning fields to 
change these settings.
Note:
Note that if you select trans white illumination, you will need to place the white 
light conversion screen on the sample stage.
A higher Binning setting (2x2, 3x3) provides optimal sensitivity for low-light 
applications such as chemiluminescence. In this mode, the pixels in the camera are 
“binned” (e.g., four pixels are combined into one) to increase the amount of signal per 
pixel without increasing noise. Note that combining the pixels results in a reduction in 
the resolution of the image.
Selecting a higher Gain (4x) provides higher sensitivity without reduced resolution; 
however, noise will also increase. This is useful for faint signals (bright spots will 
saturate). Selecting a lower gain (0.5x) is useful for brighter images that tend to 
saturate. A gain setting of 1x provides the greatest dynamic range.
Click OK to implement your changes.
After you have created an application, you can select it from the application tree by 
selecting Custom and the name you created.
Appendix I. VersaDoc
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You can edit a custom application by selecting Custom, Edit, and the name of the 
application. You can also use this feature to create a new custom application from an 
existing one.
You can delete a custom application by selecting Custom, Delete, and the name of the 
application.
I.3 Step II. Position/Focus
Before positioning and focusing the image, select the application that you will be 
using under Step I. 
Note that the optimal position and focus will be different for a filtered image versus 
an unfiltered one. (All standard applications except Chemiluminescence use a filter.)
Position
After you have selected your application, you are ready to center your gel or other 
object within the camera frame. To do so, click on the Position button. The VersaDoc 
will begin capturing a “live” image and updating it every second.
With the Position button selected, study the image in the acquisition window while 
you position your object in the center of the sample stage. If you have a zoom lens on 
the camera, you can adjust the magnification while you position. (See the VersaDoc 
User Manual for details on positioning.)
While you are positioning, you can select the Show Alignment Grid checkbox to 
display a target grid overlay on the image.
When you click on Position, the light inside the camera box automatically switches 
on. To turn the light off while positioning, deselect the Light On checkbox.
When you are finished positioning, click on the Stop button.
Focus
Note:
Before focusing, you should adjust the f-stop on the camera to the lowest setting 
(i.e., the maximum aperture). This reduces the depth of field, allowing you to 
more accurately focus the camera. Then, after focusing, increase the f-stop to the 
Quantity One User Guide
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desired setting. See Table 1, “Recommended Exposure Times and Lenses,” on 
page 9.
After you have positioned your sample, click on the Focus button and look at the 
image in the acquisition window while adjusting the focus on the camera lens. While 
focusing, the camera will limit its focus to a small portion of the sample (this will not 
affect any zoom lens adjustments you may have made.) (See the VersaDoc User 
Manual for details on focusing.)
When you click on Focus, the light inside the camera box automatically switches on. 
To turn the light off while positioning, deselect the Light On checkbox.
When you are finished focusing, click on the Stop button.
I.4 Step III. Set Exposure Time
The “exposure time” is the period of time an image is integrated on the CCD. The 
effect is analogous to exposing photographic film to light.
Setting an Exposure Time
Different applications have different optimal exposure times. If you are imaging using 
multiple channels, you can select a different exposure time for each channel. First 
select the channel using the tabs, then select the appropriate exposure time for that 
channel.
See Table 1, “Recommended Exposure Times and Lenses,” on page 9.
You can enter an exposure time (in seconds) directly in the field, or use the Arrow 
buttons to adjust the exposure time in 10 percent increments.
Fig.I-5. Selecting an exposure time.
Appendix I. VersaDoc
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The following table provides recommended exposure times for various applications
Table 1: Recommended Exposure Times and Lenses
Sample
Recommended 
Exposure
Lens & Filter
Accessories Used
Fluorescent Stain Gel 3–30 sec.
Zoom/IR
None
Fluorescence End-
Label Gel
30 sec.–5 min.
Zoom/IR
None
Fluorescent Blot
0.5–5 sec.
Zoom/IR
Sample/Chemi 
Tray (if sample is 
small)
Chemifluorescent 
Blot 
0.5–5 sec.
Zoom/IR
None
Colorimetric Gel
0.1–1 sec.
Zoom/IR
White light con-
version screen
Colorimetric Blot
0.1–1 sec.
Zoom/IR
Sample/Chemi 
Tray (if sample is 
small)
X-ray film
0.1–1 sec.
Zoom/IR
White light con-
version screen
Weak 
Chemiluminescence1
5–10 min.
50 mm
Sample/Chemi 
Tray
(if sample is 
small)
Strong 
Chemiluminescence1
10 sec.–2 min.
50 mm
Sample/Chemi 
Tray
(if sample is 
small)
1For chemi applications, the 50mm lens is recommended. Always remove the 660 fil-
ter.
Quantity One User Guide
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Note:
For most applications, you can select an exposure time, capture an image, study 
it, and then adjust the exposure time accordingly. Repeat this procedure as many 
times as necessary to obtain a good image. For chemiluminescent samples, which 
degrade over time and emit low levels of light, select a high exposure time 
initially or use the Optimize Exposure command described on page 12.
Preview
For shorter exposures, you can use Preview to test different exposure times. Click on 
the Preview button to create a preview exposure and display it in the acquisition 
window.
Note:
The camera on the VersaDoc must be at the correct operating temperature before 
capturing images. The temperature adjustment can take several minutes after the 
camera is turned on, depending on your VersaDoc model and the ambient room 
temperature. See your hardware manual for details.
A preview scan takes only half as long to create as a real scan, because the preview 
scan does not capture a “dark” image. The progress of the exposure will be displayed 
in the Exposure Status bar at the bottom of the dialog box.
You cannot save preview scans.
If you want to stop a preview scan that is in progress, click on the Stop button.
I.5 Acquire the Image
You can acquire a single exposure for each channel based on the time selected in Step 
III (Set Exposure Time), or take a series of exposures for a particular channel over a 
specified interval (Optimize Exposure).
Illumination Flat Fielding
For applications using the UV or white light transillumination, you should use the 
appropriate reference plate to ensure a uniform intensity in the image. This will 
compensate for normal variations in image pixel intensity that occur with a 
transilluminating light source.
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