mvc open pdf in new tab : Some pdf image extract control Library platform web page asp.net windows web browser caskviewer_manual_10-part972

Creating/converting a Slide for CASK Virtual Microscopy  
Developed by O.P.Gobée, Dept. Anatomy, Leiden University Medical Center,Netherlands. o.p.gobee@lumc.nl  
This manual regards CASK Microscopy Viewer Version 2.1.736, last updated 3 April 2013 
This manual is licensed under Creative Commons 'Attribute, Share alike'. 
Table of Contents 
What is this manual about? ................................................................................................................. 1
What do you need? ............................................................................................................................. 1
Steps: where to start? .......................................................................................................................... 1
Step 1. Mirax export to tif/(jpeg) (~5-15 min). ...................................................................................... 2
Step 2. Convert Tiled TIF/(jpeg) to Jpeg (2-90 min) ............................................................................ 5
Step 3. Break the Jpeg into tiles (2-5 min) .......................................................................................... 7
Appendix Size limitations ..................................................................................................................... 9
What is this manual about? 
This manual describes how to convert digital slides to the Zoomify format that is used in the 
CASK viewer.  
What do you need?  
 a digital image of a slide.  
 a computer with at least Windows 7 and at least 8GB RAM, to work efficiently you'll need  
24-32GB RAM, see: Appendix 'Size limitations' 
 software: specified per step in this manual 
Steps: where to start?
This manual starts out with a Mirax file (.mrxs), as that is the format produced by the slide 
scanner in LUMC. If you have another image format, you can skip the Mirax conversion step 
and start with a later step: 
 If you have a Mirax file (.mrxs): start with step 1 
 If you have an image in any non-jpeg format (.tiff, .bmp, etc.): start with step 2  
 If you have a .jpeg file: start with step 3 
Some pdf image extract - Select, copy, paste PDF images in C#.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WinForms, WPF
Support PDF Image Extraction from a Page, a Region on a Page, and PDF Document
extract images from pdf c#; extract pictures from pdf
Some pdf image extract - VB.NET PDF Image Extract Library: Select, copy, paste PDF images in vb.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WinForms, WPF
Support PDF Image Extraction from a Page, a Region on a Page, and PDF Document
extract images pdf acrobat; pdf image text extractor
Step 1. Mirax export to tif/(jpeg) (~5-15 min). 
a.  Install Pannoramic Viewer if you use it the first time. Get it at: 
http://www.3dhistech.com/pannoramic_viewer  
b.  Load Mirax slide in Pannoramic viewer. 
c.  Create an annotation that contains the usable part of the slide and only a small brim 
white space around. This method allows to capture the whole slide and not export too 
much. You can freely choose a name for the annotation. 
Button: 
.  
VB.NET PDF Password Library: add, remove, edit PDF file password
RasterEdge XDoc.PDF SDK provides some PDF security settings about password to help protect your PDF document in VB.NET project.
extract image from pdf; extract vector image from pdf
C# HTML5 PDF Viewer SDK to view, annotate, create and convert PDF
Here explains some usages about HTML5 PDF Viewer annotation functionalities. C#.NET: Create PDF Online in ASP.NET. C#.NET: Edit PDF Image in ASP.NET.
some pdf image extractor; how to extract images from pdf in acrobat
d. 
File> export. This results in a so-called ‘tiled TIFF’. 
Example export window: 
Settings: 
File Format: TIFF Image 
Magnification: Use the maximum size 1:1 if possible. Due to size limitations you 
sometimes have to scale down large slides to 1:2, 1:4, etc.  
IMPORTANT! Read appendix ‘Size limitations’ to determine which size you can 
handle.  
IMPORTANT! Remember the chosen magnification, you will need it later on, 
when embedding the slide in the CASK Virtual Microscopy Viewer (see Manual 2: 
Manual 2. Setting up CASK Virtual Microscopy viewer and adding slides)! 
Tile size: 256 x256 
Image codec: JPEG 
Quality: 80 
Regions to be exported: choose the annotated area you made, it has the name 
you gave in the previous step. Choosing ‘Whole Slide’ may cut off part of the 
image and export unnecessary white space in another direction. 
Destination Path: choose a suitable location on your PC where you want the 
export to be placed (button ‘Browse’).  
IMPORTANT! Prepare the file name for step 2. If you forget it and have to do this 
in step 2, the renaming takes a long time! 
 replace any spaces by underscores: ‘bla bla bla’ 
‘bla_bla_bla’  
C# PDF Password Library: add, remove, edit PDF file password in C#
Able to change password on adobe PDF document in C#.NET. To help protect your PDF document in C# project, XDoc.PDF provides some PDF security settings.
extract color image from pdf in c#; extract pictures pdf
C# Create PDF Library SDK to convert PDF from other file formats
Load PDF from existing documents and image in SQL server. creating toolkit, if you need to add some text and draw some graphics on created PDF document file
extract jpg pdf; extract image from pdf acrobat
 replace any diacritic letters by standard ASCII letters: ‘eée’ 
’eee’ 
 replace any upper case characters by lower case characters: ‘Blabla’ 
‘blabla’ (this is not absolutely necessary, but may prevent problems when you 
put your file on the server) 
VB.NET PDF Annotate Library: Draw, edit PDF annotation, markups in
mark the source PDF file by adding some comments, notes on, which integrates advanced VB.NET PDF editing functions and VB.NET image annotating features
extract jpg from pdf; how to extract pictures from pdf files
VB.NET Image: How to Process & Edit Image Using VB.NET Image
Besides, if you want to apply some popular image effects to target image file, like image sharpening, image vintage effect creating, image color adjusting and
pdf image extractor c#; extract images from pdf online
Step 2. Convert Tiled TIF/(jpeg) to Jpeg (2-90 min) 
If you want the largest sizes (=best quality) and aren’t afraid of a slightly more difficult 
interface (command-line) we advice ImageMagick. You will need preferaby at least 8GB or 
more RAM and the 64 bits version of Image Magick, see: Appendix 'Size limitations' 
ImageMagick Commandline  
a.  Install ImageMagick if you use it the first time. You can get it at: 
http://www.imagemagick.org  
b.  Browse to the folder where your image is (if you did step 1, this is the .tif you exported). If 
you didn't do so in step 1, rename the file so it doesn't contain any spaces or diacritic 
characters. This renaming takes 10 min. or more !! 
Windows 7: 
c.  Press and hold ‘Shift’ button, Right-click the folder that contains the image and choose 
‘Open command window here’. A black background window (the command window) will 
open, with the folder location (e.g. D:\microscopy) pre-entered in it. 
d.  In the command-window, behind the path, type:  
convert –monitor”       (without quotes) 
e.  Browse to and select (click on) the image file  to be converted.  
f.  Press ‘F2’ to get to the rename-option 
g.  Right-click the name, choose: Copy 
C# PDF: C# Code to Process PDF Document Page Using C#.NET PDF
and manage those PDF files, especially when they are processing some PDF document files C# PDF: Add Image to PDF Page Using C#.NET, C# PDF: Extract Page(s
how to extract images from pdf in acrobat; extract photo from pdf
C# Create PDF from images Library to convert Jpeg, png images to
It enables you to build a PDF file with one or Various image forms are supported which include Png, Jpeg, Bmp Some C# programming demos are illustrated below.
how to extract images from pdf files; extract images from pdf
h.  Right-click on the command-window, choose: Paste. The name of your file will be 
included. If it didn’t copy the extension (e.g. .tif), add it. 
i.  Type a space 
j.  Again right-click on the command-window, choose: Paste. The name of your file will 
again be included. Now give it the extension .jpg 
k.  Now you should have something in the command window like:  
D:\microscopy>convert   –monitor   carotis_human_he.tif   carotis_human_he.jpg 
.jpg 
l.  Press Enter button to run it. 
m. It will show the progress: 
n.  After finishing, it might issue a warning message, but this doesn’t seem to affect the 
result. 
Windows XP (not tested, will need Image Magick 32bit): 
 Start> cmd brings up command line window 
 Navigate to the folder where the tif is. Use standard ‘old-school DOS box commands to navigate, 
eg. ‘cd’ to go to a deeper directory or ../ to go a directory up. 
 type command: “convert –monitor image_name.tif image_name.jpg” (without quotes) 
 Press Enter button to run it. 
Photoshop method: For images up to 32767 pixels max dimension you may use Photoshop 
 Load the TIF in Photoshop or an other image editor capable of handling such large 
images. 
 ‘save for Web’ as jpeg (Photoshop issues a warning that the exporter was not designed 
for such large formats, but it does work) 
Not working: 
It appears to be impossible to directl\y convert the tif/jpeg by Zoomify (step 3). Zoomify then issues a jpeg coding 
error. Renaming the tif to jpeg also doesn’t work -> Zoomify closes directly. 
How to C#: Basic SDK Concept of XImage.Raster
VB.NET How-to, VB.NET PDF, VB.NET Word classes to convert, process, edit, and annotate image from local can load convert and save define some specified options
extract images pdf; extract images from pdf file
C#: How to Add HTML5 Document Viewer Control to Your Web Page
Note: some versions of Visual Studio use addCommand(new CommandAnnotation("image", new AnnoStyle _userCmdDemoPdf = new UserCommand("pdf"); _userCmdDemoPdf.addCSS
pdf image extractor c#; extract pdf images
Step 3. Break the Jpeg into tiles (2-5 min) 
a.  Get Zoomify-converter at:  
info:  
http://www.zoomify.com/support.htm#a_ZXv4 ,  
Windows:  
http://www.zoomify.com/downloads/products/shipping/ZoomifyExpress4-Win.zip  
Mac:  
http://www.zoomify.com/downloads/products/shipping/ZoomifyExpress4-Mac.zip  
Zoomify-express version can handle files up to 256MB, enterprise version up to 768MB. 
b.  Double click Zoomify converter.exe to run it. 
c.  Open the jpeg in it.  
A window appears showing the process running: one sees the tiles being formed.  
Medium size: tiles indicated 
Large size image 
The process results in a newly created folder (named according to the jpeg input file) 
containing a  series of subfolders: TileGroup0, TileGroup 1, TileGroup 2, etc and a file 
ImageProperies.xml
Your slide is now ready to be embedded in the CASK viewer! 
(see Manual 2. "Setting up CASK Virtual Microscopy viewer and adding slides") 
Appendix Size limitations 
There are two major limitations. The only 'hard' border is the JPEG format limitation. The 
second limitation is the amount of RAM in your PC. If you have 8GB or less you'll need a lot 
of patience. With 24GB RAM the whole process mostly can be done within half an hour per 
slide. 
Step 1) Pannoramic export 
This exports TIFF with codec JPEG or uncompressed TIFF. 
The JPEG format can handle images of maximally 65,535 px (in both directions). 
Attempting to export larger images will break the export process half way. Attempting 
to circumvent the limitation by using uncompressed TIFF format (max. 4GB) is 
useless as step 3 limits the file size, so you will need to compress to JPEG 
whatsoever in step 2. 
Step 2)  Conversion TIFF to JPEG*, ** 
You can use different image editors.  
d.  Photoshop can handle a maximum number of pixels in any direction of 32,767px. 
e.  If you aren’t afraid of a slightly more difficult interface (command-line) we advice 
ImageMagick** that does not have this limitation. Little RAM is a major hold-up in this 
step, see below
*
Step 3) Tiling of the jpeg with Zoomify 
f.  The free Zoomify Converter handles images up to 256MB. The Enterprise version 
Zoomify Converter can handle images up to 768MB.  
* The speed of the Image Magick conversion depends on the size of the image and the amount of 
RAM in your computer. To give an impression:  
Image size 
↓ 
/ RAM 
8 GB 
24 GB 
100 MB  
10 min 
1.5 min 
250 MB 
25 min 
1 hour (?) 
400 MB 
25 min 
** The image below shows the Windows Task Manager during two consecutive slide conversions in 
Image Magick on a Windows 7 (64bit) 24 GB RAM PC. RAM usage increases steeply during the initial 
load phase and slightly in the consecutive conversion phase. As long as the system doesn't reach its 
limit, the process goes fast (1-2 min). When it does reach its limit (as in the 2
nd
slide below), the 
process lengthens tremendously. 
10 
** There is also an ImageMagick in graphical user interface (GUI) version, but this cannot handle larger sizes due 
to a Windows limitation: 
Documents you may be interested
Documents you may be interested