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Bibliothèque La Pérouse  
EndNote 
Logiciel de gestion  
de références bibliographiques 
Catherine Bertignac- SCD UBO
janvier 2013 
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Sommaire 
1.
Présentation générale de EndNote ................................................................................................. 2
1.1.
Organisation générale de EndNote ........................................................................................ 2
1.2.
Installation de EndNote ......................................................................................................... 2
1.3.
Principes de fonctionnement de EndNote ............................................................................. 3
1.3.1.
Ouverture de EndNote et éléments généraux ................................................................ 3
1.3.2.
Présen
tation d’une bibliothqque
.................................................................................... 3
2.
Collecter des références bibliographiques ..................................................................................... 6
2.1.
Collecte par basculement direct des références ..................................................................... 6
2.2.
Collecte par importation de fichiers ...................................................................................... 6
2.3.
Collecte de références à partir de fichiers PDF ..................................................................... 8
2.4.
Collecte par connexion directe sur des bases de données et des catalogues ......................... 8
2.5.
Collecte par saisie manuelle des références .......................................................................... 9
2.5.1.
Choix du type de référence ............................................................................................ 9
2.5.2.
Conseils pour la saisie ................................................................................................. 10
2.6.
Collecte par capture via EndNote Web à partir du navigateur Firefox ............................... 11
2.7.
Le champ File Attachments et la recherche du texte intégral ............................................. 13
2.8.
Les champs Figure et Caption ............................................................................................. 14
2.9.
Modification et suppression des références ........................................................................ 15
2.10.
Sauvegarde des références .................................................................................................. 15
3.
Organiser les références .............................................................................................................. 16
3.1.
Gestion d’un groupe de rpfprences
...................................................................................... 16
3.2.
Suppression des doublons ................................................................................................... 17
3.3.
Affichage, tri et recherche de références ............................................................................. 17
3.4.
Les listes de termes ............................................................................................................. 18
4.
Mettre en forme les citations et créer une bibliographie ............................................................. 19
4.1.
Principes du formatage selon un style bibliographique défini ............................................ 19
4.2.
Créer une bibliographie simple sous EndNote .................................................................... 20
4.3.
Exporter des références formatées ...................................................................................... 20
4.4.
Créer des bibliographies thématiques et des listes thématiques .......................................... 20
4.5.
Insérer des citations et créer une bibliographie dans MS Word (Cite While You Write) ... 21
4.5.1.
Les commandes de Cite While You Write .................................................................. 22
4.5.2.
Démarrer la rédaction .................................................................................................. 23
4.5.3.
Insérer des citations ..................................................................................................... 23
4.5.4.
Insérer des illustrations ................................................................................................ 23
4.5.5.
Mettre en forme les citations et la bibliographie ......................................................... 24
4.5.6.
Modifier et supprimer des citations ............................................................................. 24
4.5.7.
Créer une bibliographie à partir de plusieurs documents ............................................ 25
4.5.8.
Utiliser la bibliothèque « de voyage » ......................................................................... 25
4.5.9.
Modifier ses préférences dans CWYW ....................................................................... 26
4.6.
Créer un fichier RTF formaté .............................................................................................. 26
4.6.1.
Insérer des citations : ................................................................................................... 26
4.6.2.
Formater le document .................................................................................................. 26
4.6.3.
Créer une bibliographie à partir de plusieurs documents RTF .................................... 27
4.7.
La gestion des styles bibliographiques ................................................................................ 27
5.
Personnaliser son interface et gérer ses fichiers .......................................................................... 29
5.1.
Personnaliser son interface .................................................................................................. 29
5.2.
Statistiques .......................................................................................................................... 30
5.3.
Gérer ses fichiers EndNote .................................................................................................. 30
6.
EndNote Web .............................................................................................................................. 31
7.
Aide sur EndNote ........................................................................................................................ 31
8.
Annexe 1 : Export direct dans EndNote ...................................................................................... 32
9.
Annexe 2 : Importation de fichiers .............................................................................................. 33
VB.NET PDF Text Extract Library: extract text content from PDF
Extract highlighted text out of PDF document. extraction control provides text extraction from PDF images and image Best VB.NET PDF text extraction SDK library
extract images from pdf files; how to extract images from pdf
C# PDF Text Extract Library: extract text content from PDF file in
Free online source code for extracting text from Ability to extract highlighted text out of PDF control provides text extraction from PDF images and image
extract jpg pdf; extract text from image pdf file
1. Présentation générale de EndNote 
1.1. 
Organisation générale de EndNote 
Collecter
Formater
Organiser
Connexion 
Stockage des références
S
t
y
l
e
s
Gestion des doublons
Tri / recherche des 
références
Exporter des 
références 
formatées
Sous Endnote 
Création de 
bibliographies formatées
Sous MSWord
Insertion des 
citations
Formatage des 
citations et de la 
bibliographie
Fichiers de 
connexion
Des bases de 
données et
catalogues de 
bibliothèque…
Saisie manuelle 
des références
Certaines 
bases de 
données 
et 
certains 
éditeurs
Basculement 
direct des 
références
Import
Filtres
Gestion de listes de termes
Création/modification des filtres, des 
fichiers de  connexion, des styles
•Personnalisation de l’interface
Création de listes et de 
bibliographies 
thématiques
Création de fichiers RTF 
formatés
Création de groupes
Modification / sauvegarde 
des références
Ajout du texte intégral
Capture via 
Firefoxet 
EndNote
Web
PDF avec 
DOI
EndNote est un logiciel de gestion de références bibliographiques qui permet de  
-collecter ou saisir des références bibliographiques (articles, ouvrages, communications à des 
colloques, rapports, etc.) pour créer sa propre base de données, 
-organiser ces références, par exemple en les répartissant par groupe, en supprimant les 
doublons,  
-mettre en forme ces références, selon le style bibliographique choisi, sous forme de liste ou 
par insertion dans un traitement de texte. 
Ce document décrit la version X6. 
1.2. 
Installation de EndNote  
Le logiciel EndNote est produit par la Société Thomson ResearchSoft. Chaque détenteur de licence 
peut installer le logiciel sur 3 ordinateurs personnels mais ne doit utiliser qu’une seule installation à 
la fois. 
EndNote  X6 fonctionne avec  
-Microsoft Windows 7 et 8, Windows Vista, Windows XP Service Pack 3 et plus, 
-Mac OS X (10.5.x, 10.6.x, 10.7.x) et Intel Mac. 
Il est recommandp de l’installer sur un 
ordinateur avec 256 MB de RAM minimum et un disque dur 
comprenant un espace libre d’au moins 
400 MB. 
La barre outils donnant accès aux raccourcis vers les fonctions de EndNote 
s’installe sous
:  
-Microsoft Office Word pour Windows 2003, 2007, 2010, 2013 
-OpenOffice.org version 3 Writer 
-Microsoft Word pour Mac 2008 (SP1) et plus 
-
Mac Apple iWorks Pages ’09
et plus.  
C# HTML5 Viewer: Load, View, Convert, Annotate and Edit Raster
C#.NET RasterEdge HTML5 Viewer supports convert images to Tiff (.tif, .tiff) online, create PDF document from images. Raster Images Annotation.
extract pdf pages to jpg; extract color image from pdf in c#
VB.NET PDF- View PDF Online with VB.NET HTML5 PDF Viewer
PDF to text, C#.NET convert PDF to images, C#.NET file & pages edit, C#.NET PDF pages extract, copy, paste C#.NET read barcodes from PDF, C#.NET OCR scan PDF.
how to extract a picture from a pdf; extract images from pdf c#
Sans installation de Microsoft Word ou OpenOffice.org Writer, la procédure de formatage est un peu 
plus complexe, mais EndNote 
peut scanner et crper une bibliographie formatpe d’un document RTF 
dans  lequel seraient insérées des citations temporaires. Ces documents RTF peuvent être créés avec 
MS Word, Word Perfect, OpenOffice.org Writer, StarOffice et WordPad. 
1.3. 
Principes de fonctionnement de EndNote  
1.3.1. Ouverture de EndNote et éléments généraux 
Pour lancer EndNote, il faut aller dans Démarrer/Tous les programmes et choisir EndNote puis 
EndNote Program  ou aller dans C:\Program files\EndNote X6\EndNote.exe\ 
Au démarrage, il est possible : 
-soit de créer une nouvelle bibliothèque (library), cad une base EndNote dans laquelle seront 
stockées les références via File/New 
-
soit d’ouvrir une bibliothqque existante. 
Les bibliothèques créées avec les versions EndNote 
8, 9, X, X1, X2, X3, X4, X5 and X6 peuvent être ouvertes sous EndNote X6
1
.  
Il est possible de personnaliser 
l’ouverture et d’accpder directement à la base de travail habituelle 
(Edit/Preferences/Libraries). 
Les bibliothèques créées avec EndNote X6, sont totalement compatibles avec EndNote X, X1, X2, 
X3, X4. Les nouvelles fonctionnalités de EndNote X6 sont simplement ignorées par les versions 
antérieures. 
1.3.2. 
Présentation d’une bibliothèque
Une bibliothèque rassemble des références bibliographiques dont les éléments descriptifs sont 
disposés dans des champs bibliographiques (champs auteur, titre, année, résumé, etc.). 
Il est possible de créer un nombre illimité de bibliothèques ; néanmoins, il est conseillé de ne créer 
qu’une seule
base personnelle.  
Une bibliothèque est sauvegardée dans le répertoire de son choix (via File/Save a copy). Il vaut 
mieux créer un répertoire spécifique pour stocker sa base et les fichiers de travail.  
Une bibliothèque peut être accessible simultanément par plusieurs utilisateurs (recherche, copie) 
mais un seul peut faire des modifications. 
Par dpfaut, à l’ouverture d’une bibliothqque
2
, la fenêtre principale affiche toutes les références de la 
bibliothèque (All References) ; une ligne correspond à une référence et une colonne à un champ. Il 
est possible d’afficher 10
champs maximum. 
1
Une bibliothèque de ProCite peut également être ouverte mais les informations des champs comme Connective Phrase 
et Author Role seront transférées dans le champ Notes de EndNote (voir Aide « ProCite »). Pour les bases provenant de 
Reference Manager, voir l’Aide mot clp Refe
rence Manager.
2
Exemple de la bibliothèque Sample_Library disponible sous C:// Program Files/EndNote X6/Examples. 
VB.NET PDF Page Extract Library: copy, paste, cut PDF pages in vb.
Use corresponding namespaces; using RasterEdge.Imaging.Basic; using RasterEdge.XDoc.PDF; VB.NET: Extract All Images from PDF Document.
extract text from pdf image; pdf extract images
C# HTML5 PDF Viewer SDK to view PDF document online in C#.NET
Form Process. Data: Read, Extract Field Data. Data: Auto Redact Text Content. Redact Images. Redact Pages. Annotation & Add Text Box. Drawing Markups. PDF Print.
extract photos from pdf; extract image from pdf file
Il y a 3 modes d’affichage possibles
-bibliothèque locale : vue des dossiers sauvegardés localement 
-bibliothèque en ligne : vue des recherches via la connexion en ligne 
-version complète (conseillée), regroupant les dossiers locaux et de connexion 
La partie de gauche intitulée My Library donne la liste des groupes dans lesquels peuvent se répartir 
les références.  
Sur la page listant les références, une barr
e d’icônes propose des raccourcis vers certaines fonctions
Lorsque le curseur est positionné sur une référence, tous les champs de la référence apparaissent dans 
la partie droite « Référence ». Elle apparaît mise en forme au style bibliographique sélectionné par 
défaut 
sous l’onglet «
Preview ».  
En double-cliquant sur une référence, celle-ci 
s’affiche alors 
dans une nouvelle fenêtre où se trouvent 
des options complémentaires 
d’ajouts, de corrections, etc. 
VB.NET PDF - Convert PDF Online with VB.NET HTML5 PDF Viewer
NET read PDF, VB.NET convert PDF to text, VB.NET extract PDF pages, VB Able to set scaling value of converted images. VB.NET HTML5 PDF Viewer: Convert PDF Online.
how to extract images from pdf file; pdf image extractor
VB.NET PDF - Create PDF Online with VB.NET HTML5 PDF Viewer
PDF to text, C#.NET convert PDF to images, C#.NET file & pages edit, C#.NET PDF pages extract, copy, paste C#.NET read barcodes from PDF, C#.NET OCR scan PDF.
pdf image text extractor; extract image from pdf acrobat
A ce niveau il est possible de modifier la référence 
(texte, police, …)
. Les modifications sont 
enregistrées lors de la 
fermeture de la fenrtre d’affichage de la rpfprence.
Une barre d’icônes propose des raccourcis vers certaines fonctions
2. Collecter des références bibliographiques 
Les références bibliographiques peuvent être collectées de 6 manières :  
-à partir de certaines bases de données et de certains éditeurs de revues électroniques, par 
basculement direct des références dans EndNote.  
-par importation de fichiers de références sauvegardées dans des bases de données ou chez 
des éditeurs,  
-à partir de fichiers pdf 
-par connexion directe à certaines bases de données ou à certains catalogues de bibliothèque 
puis rapatriement des références, 
-par saisie manuelle des éléments de la référence dans EndNote. 
-
(peu satisfaisant en l’ptat actuel) par capture via EndNote Web à partir du navigateur sur 
Internet. 
La capacité de stockage de références dans EndNote est illimitée, mais, pour des questions de gestion, 
il est conseillé de ne pas dépasser 100 000 références. 
2.1. 
Collecte par basculement direct des références 
Pour la majorité des bases de données et des éditeurs auxquels est abonnée la BLP il est possible et 
conseillé de basculer directement les références de la plateforme consultée à EndNote. Ceci possible 
pour: 
-les bases du serveur ISI Web of Knowledge, cad les bases Web of Science et Medline, 
-les principaux éditeurs de revues électroniques, cad Elsevier, Blackwell, Springer, Oxford 
University Press, JSTOR,  
-ainsi que pour les revues NatureScience  
La collecte par basculement direct des rpfprences suppose l’accqs aux bases de donnpes et aux revues 
sur son poste de travail. 
Le principe consiste à activer une fonction d’export des rpfprences 
sélectionnées au niveau de la plateforme consultée.  
La procédure est détaillée en Annexe 1 pour les principaux serveurs et éditeurs.  
2.2. 
Collecte par importation de fichiers 
EndNote 
permet d’importer un fichier de rpfprences issues d’une base de donnpes, d’pditeurs de 
revues, de catalogues de bibliothèq
ues, d’autres gestionnaires bibliographiques…grâce à l’utilisation 
d’un filtre d’importation. Un filtre est sppcifique à chaque base de donnpe, catalogue, site pditeur…
Pour que la collecte soit opérationnelle, il faut que : 
-le fichier à importer soit «marqué » (exemple : TI- Aquatic Macrophytes and Lake 
acidification, PY- 
1993, …) pour que les informations soient dirigpes par le filtre vers les bons 
champs dans EndNote
. Il ne peut s’agir que de fichiers texte ou de fichiers 
EndNote. 
-
les filtres d’impo
rtation soient installés sur le poste de travail. Ils sont visibles via 
Edit/Import Filters/Open Filter Manager
La démarche pour importer un fichier de références : 
L’importation se fait dans 
EndNote 
sous l’onglet 
File/Import/File 
-choisir le fichier de références à importer (Import File
-
choisir le filtre d’importation (
Import Option). Parmi ceux-ci, il y a :  
-EndNote Import : pour importer des fichiers texte provenant de bases de données en ligne 
ou exportés depuis EndNote en format EndNote 
-ReferBibIX : pour importer des fichiers texte provenant de logiciels Refer ou BibIX 
-Tab-delimited : pour importer des fichiers dans lesquels les champs de chaque référence 
sont séparés par des tabulations (<tab>) et les références séparées les unes des autres par un 
marqueur de paragraphe (¶). C’est le cas de fichiers Excel par exemple.
-RefMan RIS : pour importer des références de gestionnaires bibliographiques comme 
ProCite, Reference Manager, EndNote Web, Zotero, Mendeley. 
-ISI-CE : pour importer des fichiers texte venant des bases ISI 
-Other Filters : accès à plusieurs centaines de fichiers correspondant à des fichiers 
sauvegardés dans des bases de données en ligne. 
-il est possible de supprimer automatiquement les doublons (Duplicates/Discard Duplicates) ou 
de les transférer vers une bibliothèque de doubles (Import into Duplicates Library
) ou d’importer 
la totalité des références (Import All
-il est possible de spécifier le type de caractères dans le fichier importé (Text translation).  
Les références importées sont affichées seules dans une nouvelle fenêtre (Imported References). Il 
est conseillp de vprifier que l’importation s’est faite correctement et d’ajouter à ce niveau les 
informations utiles (mots-
clps, base de provenance, date d’importation par 
exemple
3
).  
Le retour à l’affichage complet des rpfprences se fait en cliquant sur 
All References
Pour les bases accessibles via le portail de la BLP, les modalitps de constitution et d’importation des 
fichiers sont indiquées en Annexe 2. 
De nouveaux fi
ltres d’importation peuvent rtre crpps via 
Edit/Import Filters/New Filter
Pour modifier un filtre, il faut aller dans Edit/ Import Filters/Open Filter Manager, sélectionner le 
filtre puis cliquer sur Edit 
pour l’ouvrir. Les plpments importants du paramptr
age se trouvent dans la 
partie « templates » qui définit la correspondance entre les champs des références de la base de 
donnpes d’origine et les champs 
EndNote pour chaque type de référence. 
Exemple de filtre d’importation (
Web of Science (TS)) : 
3
Pour insérer une information dans un champ particulier de toutes les références, aller dans Tools/Change/Move/Copy 
Fields, choisir le champ et insérer le texte. 
2.3. 
Collecte de références à partir de fichiers PDF 
Il est parfois possible de rpcupprer les mptadonnpes d’un ou plusieurs fichier PDF tout en intpgrant le 
texte intégral à la (aux) référence(s). Il faut que le PDF contienne une information sur le DOI (Digital 
Ob
ject Identifier). C’est ce DOI qui va permettre d’alimenter les 
champs de la nouvelle référence : 
titre, auteur, volume, numéro, année et DOI. Le PDF est inséré comme fichier attaché. 
La démarche : 
-activer Import Files et sélectionner le PDF (via File) ou le dossier comprenant des PDFs 
(via Folder
-dans Import Option, choisir 
le filtre d’importation
PDF  
-Il est possible de supprimer automatiquement les doublons (Discard Duplicates) ou de les 
transférer vers une bibliothèque de doubles (Import into Duplicates Library
) ou d’importer la 
totalité des références (Import All
-Il est possible de spécifier le type de caractères dans le fichier importé (Text translation).  
Cliquer sur Import. 
Tant que la ou les références sont dans le groupe temporaire Imported Références, ajouter les 
complpments d’information (
résumé, mots clés, etc.) 
2.4. 
Collecte par connexion directe sur des bases de données et 
des catalogues 
La connexion directe sur des bases de données et des catalogues de bibliothèques se fait pour les 
bases répondant aux normes « Z39.50 » via un fichier de connexion adéquat. 
Elle permet de les interroger depuis l’interface d’
EndNote de manière simple et rapide et de créer 
immédiatement un fichier EndNote, mais elle ne permet souvent pas de recherche aussi avancée que 
sous l’interface d’origine.
Sont ainsi accessibles : 
-toutes les bases disponibles sur la plateforme ISI : Web of Science SCI (Science Citation 
Index Expanded), Web of Science SSCI (Social Sciences Citation Index), Web of Science ISI (tous 
les 
index de l’abonnement), 
ISI Proceedings (ISI), Medline (ISI). 
-des bases de données en accès libre comme PubMed (NLM), American Geophysical Union 
(EASI) 
et certains catalogues comme ceux de la Woods Hole Oceanographic Institution (Woods Hole 
OI), de la Library of Congress, de la British Library, de la NOAA, de la Bibliothèque Nationale de 
France (Bib natl de France),
….
Il est possible de récupérer des fichiers de connexion 
complémentaires, comme celui du SUDOC (ABES), sur le site de EndNote :  
http://endnote.com/downloads/connections 
Les catalogues de l’Ifremer et de la BLP ne sont pas accessibles par ce biais.
La démarche : 
-aller dans Tools/Online Search 
ou cliquer sur l’icône de raccourci dans la
barre-outils  
ou dans la colonne Groups dans Online Search cliquer sur « more ». 
-sélectionner le fichier de connexion à la base
4
et cliquer sur Choose  
-Une fenêtre de recherche s
’affiche 
à 
l’pcran
-
choisir les champs où va s’effectuer la recherche, ains
i que les opérateurs entre les termes et 
les lignes (« and », « or », « not ») puis cliquer sur Search 
4
Des fichiers de connexions complémentaires sont mis à disposition et téléchargeables sur le site 
http://www.EndNote.com/support/enconnections.asp 
-une nouvelle fenêtre affiche le nombre de références trouvées. Une fois sélectionné le 
nombre que l’on veut rapatrier, elles s’affichent à l’pcran et s’
insèrent dans un groupe de 
Online Search correspondant au filtre de connexion et dans All references
-pour interrompre momentanément la recherche, cliquer sur Options/Pause. Pour reprendre 
la recherche, cliquer sur Options/Resume
2.5. 
Collecte par saisie manuelle des références 
La saisie manuelle d’une nouvelle rpfprence se fait via 
References/New Reference
2.5.1. Choix du type de référence 
La saisie d’une nouvelle rpfprence dpbute par le choix du type de la rpfpr
ence qui sera décrite. Il y a 
48 types de références disponibles dont: 
-Electronic article : article électronique, publié en ligne uniquement 
-Journal article : article de revue publié sous forme papier 
-Conference paper : communication à un colloque 
-Conference proceedings : actes de colloque 
-Thesis : thèse 
-Web Page : site ou page Web 
-Book : ouvrage écrit par un ou plusieurs auteurs, appartenant ou non à une collection 
-Book section 
: extrait de d’ouvrage
-Edited Book : numéro spécial de revue ou ouvrage collectif avec un éditeur scientifique 
-Electronic Book : livre électronique 
-Patent : brevet 
-Report : rapport 
-Chart or Table : graphe ou tableau 
... 
-Generic sert essentiellement de référence pour tous les autres types;  toutes les fonctionnalités 
de EndNote basées sur les intitulés de champs, par exemple la recherche de références, utilisent 
ceux du type Generic.  
+ 3 Unused : types disponibles non définis pour créer des types de document personnels. 
Le choix du type de référence détermine les champs associés : 
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