open pdf from windows form c# : Delete text pdf document software SDK dll windows wpf .net web forms RainSTORM_user_guide1-part1679

Saved File Types 
hists 
info 
JHistImage 
onScreenImage 
STORMdataImage 
sum 
Delete text pdf document - delete, remove text from PDF file in C#.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WinForms, WPF
Allow C# developers to use mature APIs to delete and remove text content from PDF document
how to remove highlighted text in pdf; pull text out of pdf
Delete text pdf document - VB.NET PDF delete text library: delete, remove text from PDF file in vb.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WinForms, WPF
VB.NET Programming Guide to Delete Text from PDF File
how to erase in pdf text; how to erase pdf text
Resolution and Image Quality 
Metrics 
Candidate brightness: This is related to the number of photons per candidate molecule. If the dye 
blinking density is high (non-sparse) a large tail or second peak can be seen at higher signal counts. 
Localisations per Frame: In sparse blinking samples illuminated with constant laser power a gradual 
decline in accepted localisations will be seen (as above). A sudden drop in localisation number can be a 
result of focus drift or inappropriate change in illumination conditions, resulting in either many 
overlapping signals  (non-sparse) blinking or no blinking at all. A gradually increasing accepted 
localisation number tends to indicate a transition from too dense to sparse blinking as more dyes are 
bleached. 
Pixel Widths (PSF Sigma): Represents the width of each candidate position in the raw image. Assuming a 
pixel size of 160 nm and using Alexa 647 or similar this value should be at 1.3. Larger values are 
indicative of spherical aberration (check the glass thickness, immersion oil and objective lens correction 
collar), defocus (poor focusing and/or a sample with fluorophores at variable Z positions, or too high 
blinking densities resulting in mislocalisations). 
Thompson Localisation Precisions: Is generated from every localisation and is based on the emitted 
photons (signal counts calibration). A large peak between 15-30 nm should be seen in good quality 
datasets. 
Greyed out regions show data that has been excluded from the reviewed super-resolution image. Large 
differences in row and column directions are indicative of high density blinking (non-sparse) in samples 
with orientation such as actin filaments or microtubules. 
Rees et al. Opt. Nanoscopy 1(1), 12 (2012).  
Alternative approaches to quantifying resolution are explained by Ram et al, PNAS, 2005, 
doi10.1073pnas.0508047103 and Nieuwenhuizen et al., Nature Methods, 2013, doi:10.1038/nmeth.2448  
VB.NET PDF Page Delete Library: remove PDF pages in vb.net, ASP.
VB.NET PDF - How to Delete PDF Document Page in VB.NET. Visual Basic Sample Codes to Delete PDF Document Page in VB.NET Class. Free
pdf editor online delete text; delete text in pdf file online
C# PDF Page Delete Library: remove PDF pages in C#.net, ASP.NET
C#.NET PDF Library - Delete PDF Document Page in C#.NET. Provide C# Users in C#.NET. How to delete a single page from a PDF document.
delete text pdf acrobat professional; delete text from pdf with acrobat
Precision Limit: This is an estimate of the image resolution based on the signal counts calibrated to 
photons from the raw data. In this case it is a guide line for the best case  ability to discriminate two 
objects as being separate. If certain parts of the raw images contained high background signal these 
areas will have worse resolution than indicated. Areas with much higher contrast than the rest of the 
image will have better resolution. This resolution number does not account for labelling size (in the 
case of antibody labelling up to 15 nm of distance may be added between fluorophore and molecule of 
interest). It also does not account for any drift during the image acquisition. 
Mean Precision Estimate: This is based on the calculated Thompson localisation precisions. 
Number of accepted localisations: The number of data points in the final image. Being more stringent 
with quality control criteria will reduce the number of localisations in the final image and can lead to a 
pointillist (dotty) image. In other words, it has been undersampled. 1 localisation – 1 blink. If that blink 
is spread out across more than one frame it will get localised in each one, i.e. no time-based 
assessments are made. 
Overall image quality is dependent on: 
Structures of interest being well labelled – i.e. there is fluorophore attached to most or all of the 
molecules of interest 
Accepted localisation number – a sufficient number of those labelled molecules have been imaged 
Mean precision estimate – each of those molecules has been imaged well enough to be accurately 
positioned (a function of photons against background and being in focus) 
Drift – minimal or no movement of the sample in relation to the objective lens throughout the image 
acquisition 
Visualisation – an appropriate pixel size in simple histogram visualisation method (recommended to 
use a value the same as the mean precision estimate value). This does not apply when using the 
jittered histogram method, which is better in most cases than the simple histogram. 
Resolution and Image Quality 
Metrics 
For more on this see Rees et al, Journal of Optical Nanoscopy, 2012 
C# PDF Text Extract Library: extract text content from PDF file in
Free online source code for extracting text from adobe PDF document in C#.NET class. Ability to extract highlighted text out of PDF document.
how to delete text from pdf; how to delete text from pdf with acrobat
VB.NET PDF Text Extract Library: extract text content from PDF
SharePoint. Extract text from adobe PDF document in VB.NET Programming. Extract file. Extract highlighted text out of PDF document. Image
how to delete text from a pdf; delete text pdf document
Comparison of Visualisation 
methods 
Jittered histogram  
Simple histogram  
(25 nm pixels) 
Simple histogram  
(40 nm pixels) 
Simple histogram  
(10 nm pixels) 
Simple histogram  
(25 nm pixels) 
In localisation microscopy, a visualisation method is used to convert the localised positions into a 
reconstructed image of the underlying specimen. Several different visualisation algorithms exist 
[Baddeley, 2010, Microsc. Microanal. 16 64–72], and the best of these tend to be based on Density 
Estimation Theory [Silverman, Density Estimation for Statistics and Data Analysis, CRC Press 1985].  
A ‘Simple Histogram’ visualisation reconstructs an image in which the brightness of each of its pixels is 
proportional to the number of localisations that fall within it. This benefits from simplicity, but requires 
an optimal choice of pixel size to be made by the user, and also suffers from arbitrary variation due to 
pixel edge-position.  
The method of Gaussian Rendering (Baddeley) plots each localisation as a smooth Gaussian ‘bump’ of 
density – the width of each bump may be optimally scaled (by ‘Adaptive Kernel Density Estimation’) to 
suit the precision and density of localisations.  
The ‘Jittered Histogram’ visualisation [Kricek Opt. Express 19 3226–35] is effectively a digitised form of 
Gaussian rendering, and in rainSTORM the Jittered Histogram visualisation does employ a form of 
adaptive width smoothing. 
C# PDF insert text Library: insert text into PDF content in C#.net
C#.NET PDF SDK - Insert Text to PDF Document in C#.NET. This C# coding example describes how to add a single text character to PDF document. // Open a document.
delete text from pdf acrobat; how to delete text from a pdf in acrobat
C# PDF Convert to Text SDK: Convert PDF to txt files in C#.net
All text content of target PDF document can be copied and pasted to .txt files by keeping original layout. C#.NET class source code
how to delete text from pdf document; how to delete text in a pdf acrobat
Box Tracking and Fiduciary Drift 
Correction : Detecting Drift 
(1) Process the data review and save 
images as described 
(2) Using the zoom tool identify a region of 
interest with distinctive structure (in this 
case what looks like a thick actin filament) 
(3) Press Box Tracking & highlight an ROI 
with the cross hairs on the reviewed image 
(4)  Wait  a  few  seconds  and  a  Boxed 
Positions  image  will  appear,  with 
localisations colour coded as a function of 
frame number (ie. time). 
For more see Metcalf et al, JoVE, 2013 
A displacement of the different colours is an indication that there may be drift present in the image 
C# PDF metadata Library: add, remove, update PDF metadata in C#.
C#.NET PDF SDK - Edit PDF Document Metadata in C#.NET. Allow C# Developers to Read, Add, Edit, Update and Delete PDF Metadata in .NET Project.
how to delete text from pdf reader; remove text watermark from pdf
C# PDF Text Search Library: search text inside PDF file in C#.net
C#.NET. C# Guide about How to Search Text in PDF Document and Obtain Text Content and Location Information with .NET PDF Control.
pdf text remover; remove text from pdf preview
Box Tracking and Fiduciary Drift 
Correction: Drift Correction 
(2) Using the zoom tool identify a fiducial marker 
(3) Press “ ox Tracking” & highlight the 
bead with cross hairs 
(4) Wait a few seconds and a “ oxed 
Positions”  image  will  appear,  with 
localisations  colour-coded  as  a 
function of frame number (i.e. time). 
(5) Press “Set Anchor” 
(6) Press “Subtract Drift” 
(7) Run Reviewer to generate a new drift 
corrected image (without the bead included) 
(8) To remove other beads from the image use 
box  tracking  to  highlight  a  bead  then  press 
“Delete  oxed”  to  remove  it.  Repeat  for 
additional beads and then run reviewer a final 
time. 
For more see Metcalf et al, JoVE, 2013 
(1) Process the data review and save images as 
described 
Optical Offset Evaluation and 
Correction 
(3) Process channel 1 (eg. red), review and save 
image. 
(1) Add Tetraspeck beads (or similar) with dyes of 
appropriate wavelengths using the same type of 
glass as the sample. 
(2)  Take  a  single  image  at  each  relevant 
wavelength  (with  appropriate  laser  lines  and 
filters) for example 640 nm excitation for a ‘red’ 
channel and 561 nm for a ‘green’ channel 
(4) Press “ apture Ch1” 
(7) Press “Eval Ch2” offset 
(8) Capture the red channel from the sample, process, review and save data. 
(9) Capture the green channel from the sample, process and review. 
(10) Press “Subt Ch2 offset”, run reviewer and save data (this channel has now been corrected with 
respect to Ch1). 
This chromatic offset 
correction can be 
applied to all images 
acquired at the same 
wavelengths so long as 
there are no changes to 
detection path of the 
microscope. For more 
see Erdelyi et al., Optics 
Express, 2013 
(6) Press “ apture Ch2” 
(5) Process channel 2 (eg. green), review and save image. 
Tetraspeck beads before and after Offset Correction 
Before 
After 
Batch Processing 
Only available in the MATLAB (not compiled) version of rainSTORM 
(1) Process a file, review and save as normal. All subsequent  batch processed files 
will be processed using the same settings as this one. 
(2) In MATLAB, open file and select rainSTORM_extras_batch process.m 
(3) In the editor window click run and then navigate to a folder containing tif files 
to be batch processed. Select a file. 
(4) rainSTORM will now process all of the files in that folder. If not parallel 
processing a waitbar will be displayed for each image. Make sure the computer 
doesn’t go into screen saver or auto-logout modes as the histogram and on screen 
images will not be properly saved. 
Particle Tracking 
In development 
(1) Process a file, review and save as normal.  
(2) In MATLAB, open file and select rainSTORM_extras_TrajectoryFitting.m 
(3) In the editor window click run and trajectory images will be generated 
Only available in the MATLAB (not compiled) version of rainSTORM 
3D Astigmatism 
In development 
Documents you may be interested
Documents you may be interested