c# convert pdf to image open source : C# read pdf form fields SDK control service wpf azure html dnn Format17-part420

PDB File Format v. 3.2 
Page 167 
HETSYN 
Overview 
This record provides synonyms, if any, for the compound in the corresponding (i.e., same hetID) 
HETNAM record. This is to allow greater flexibility in searching for HET groups. 
Record Format 
COLUMNS       DATA TYPE     FIELD          DEFINITION 
---------------------------------------------------------------------------- 
1 -  6       Record name   "HETSYN" 
9 - 10       Continuation  continuation   Allows concatenation of multiple records. 
12 - 14       LString(3)    hetID          Het identifier, right-justified. 
16 - 70       SList         hetSynonyms    List of synonyms. 
Details  
* The wwPDB does not guarantee a complete list of possible synonyms. New synonyms may be 
added. The list can be continued onto additional HETSYN records. Even if the same hetID appears 
on more than one HET record, only one set of HETSYN records is included for the hetID.  
Verification/Validation/Value Authority Control  
For each HETSYN record in the entry, the corresponding HET, HETNAM, FORMUL, HETATM, and 
CONECT records must appear.  
Relationships to Other Record Types  
If there is a HETSYN record there must be corresponding HET, HETNAM, FORMUL, HETATM, and 
CONECT records. LINK records may also be created.  
Example 
1         2         3         4         5         6         7         8 
12345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890 
HETSYN     HV5 3-METHYL-L-VALINE  
HETSYN     AB1 ABT-378; LOPINAVIR 
HETSYN     CMP CYCLIC AMP; CAMP 
HETSYN     TRS TRIS BUFFER;  
C# read pdf form fields - extract form data from PDF in C#.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WPF
Help to Read and Extract Field Data from PDF with a Convenient C# Solution
extract data from pdf file to excel; pdf data extraction to excel
C# read pdf form fields - VB.NET PDF Form Data Read library: extract form data from PDF in vb.net, ASP.NET, MVC, Ajax, WPF
Convenient VB.NET Solution to Read and Extract Field Data from PDF
pdf form field recognition; extract pdf data to excel
PDB File Format v. 3.2 
Page 168 
FORMUL 
Overview 
The FORMUL record presents the chemical formula and charge of a non-standard group. 
Record Format 
COLUMNS        DATA TYPE     FIELD         DEFINITION 
----------------------------------------------------------------------- 
1 -  6        Record name   "FORMUL" 
9 - 10        Integer       compNum       Component number. 
13 - 15        LString(3)    hetID         Het identifier. 
17 - 18        Integer       continuation  Continuation number. 
19             Character     asterisk      "*" for water. 
20 - 70        String        text          Chemical formula. 
Details 
* The elements of the chemical formula are given in the order C, H, N, and O, with other elements 
following in alphabetical order, each separated by a single space.  
* The number of each atom type present immediately follows its chemical symbol without an 
intervening blank space. There will be no number indicated if there is only one atom for a particular 
atom type. 
* Each set of SEQRES records and each HET group is assigned a component number in an entry. 
These numbers are assigned serially, beginning with 1 for the first set of SEQRES records. In 
addition:  
If a HET group is presented on a SEQRES record its FORMUL is assigned the component 
number of the chain in which it appears. 
If the HET group occurs more than once and is not presented on SEQRES records, the 
component number of its first occurrence is used. 
* All occurrences of the HET group within a chain are grouped together with a multiplier. The 
remaining occurrences are also grouped with a multiplier. The sum of the multipliers is the number 
equaling the number of times that that HET group appears in the entry.  
* A continuation field is provided in the event that more space is needed for the formula.  
C# PDF Image Extract Library: Select, copy, paste PDF images in C#
C#.NET extract image from multiple page adobe PDF file library Extract various types of image from PDF file, like XObject Image, XObject Form, Inline Image
collect data from pdf forms; extract pdf form data to xml
C# PDF Text Extract Library: extract text content from PDF file in
XDoc.PDF ›› C# PDF: Extract PDF Text. C# PDF - Extract Text from PDF in C#.NET. Best C#.NET PDF text extraction library and component for free download.
how to make a pdf form fillable in reader; flatten pdf form in reader
PDB File Format v. 3.2 
Page 169 
Columns 17 - 18 are used in order to maintain continuity with the existing format.  
Verification/Validation/Value Authority Control 
For each het group that appears in the entry, the corresponding HET, HETNAM, FORMUL, HETATM, 
and CONECT records must appear. The FORMUL record is generated automatically by PDB 
processing programs using the het group template file and information from HETATM records.  UNL, 
UNK and UNX will not be listed in FORMUL even though these het groups present in the coordinate 
section. 
Relationships to Other Record Types 
For each het group that appears in the entry, the corresponding HET, HETNAM, FORMUL, HETATM, 
and CONECT records must appear.  
Example 
1         2         3         4         5         6         7         8 
12345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890 
FORMUL   2  SO4    2(O4 S 2-) 
FORMUL   3  GLC    C6 H12 O6 
FORMUL   3  FOL    2(C19 H17 N7 O6 2-) 
FORMUL   4   CL    2(CL 1-)  
FORMUL   5   CA    2(CA 2+) 
FORMUL   1  ACE    C2 H4 O  
FORMUL   2  UDP    C9 H14 N2 O12 P2                                              
FORMUL   3  B3P    C11 H26 N2 O6       
FORMUL   8  HOH   *463(H2 O) 
Known Problems 
Partially deuterated centers are not well represented in this record. 
C# PDF Library SDK to view, edit, convert, process PDF file for C#
PDF SDK for .NET allows you to read, add, edit, update Please refer to this C# guide to learn how to for .NET to insert, delete and update PDF form fields in C#
html form output to pdf; how to save pdf form data in reader
C# PDF File Compress Library: Compress reduce PDF size in C#.net
C#.NET PDF Document Optimization. resources: Since images are usually or large size, images size reducing can help to reduce PDF file size Flatten form fields.
extracting data from pdf forms to excel; how to save a filled out pdf form in reader
PDB File Format v. 3.2 
Page 170 
5. Secondary Structure Section 
The secondary structure section of a PDB formatted file describes helices, sheets, and turns found in 
protein and polypeptide structures.    
HELIX 
Overview 
HELIX records are used to identify the position of helices in the molecule. Helices are named, 
numbered, and classified by type. The residues where the helix begins and ends are noted, as well 
as the total length.  
Record Format 
COLUMNS        DATA TYPE     FIELD         DEFINITION 
----------------------------------------------------------------------------------- 
1 -  6        Record name   "HELIX " 
8 - 10        Integer       serNum        Serial number of the helix. This starts 
at 1 and increases incrementally. 
12 - 14        LString(3)    helixID       Helix identifier. In addition to a serial 
number, each helix is given an  
alphanumeric character helix identifier. 
16 - 18        Residue name  initResName   Name of the initial residue. 
20             Character     initChainID   Chain identifier for the chain containing 
this helix. 
22 - 25        Integer       initSeqNum    Sequence number of the initial residue. 
26             AChar         initICode     Insertion code of the initial residue. 
28 - 30        Residue name  endResName    Name of the terminal residue of the helix. 
32             Character     endChainID    Chain identifier for the chain containing 
this helix. 
34 - 37        Integer       endSeqNum     Sequence number of the terminal residue. 
38             AChar         endICode      Insertion code of the terminal residue. 
39 - 40        Integer       helixClass    Helix class (see below). 
41 - 70        String        comment       Comment about this helix. 
72 - 76     Integer     length      Length of this helix. 
How to C#: Basic SDK Concept of XDoc.PDF for .NET
›› C# PDF: Basic SDK Concept. C#.NET PDF: Basic Concept of .NET XDoc.PDF SDK. Introductions to Classes and APIs Included in .NET XDoc.PDF for C# Programming.
extract data from pdf into excel; extract pdf data into excel
C# PDF File Merge Library: Merge, append PDF files in C#.net, ASP.
form. Append one PDF file to the end of another and save to a single PDF file. Merge PDF with byte array, fields. Merge PDF without size limitation. RasterEdge
make pdf form editable in reader; cannot save pdf form in reader
PDB File Format v. 3.2 
Page 171 
Details 
* Additional HELIX records with different serial numbers and identifiers occur if more than one helix is 
present. 
* The initial residue of the helix is the N-terminal residue. 
* Helices are classified as follows: 
CLASS NUMBER 
TYPE OF HELIX           
(COLUMNS 39 - 40) 
-------------------------------------------------------------- 
Right-handed alpha (default)                1 
Right-handed omega                          2 
Right-handed pi                             3 
Right-handed gamma                          4 
Right-handed 310                            5 
Left-handed alpha                           6 
Left-handed omega                           7 
Left-handed gamma                           8 
27 ribbon/helix                             9 
Polyproline                                10 
Relationships to Other Record Types  
There may be related information in the REMARKs. 
Example 
1         2         3         4         5         6         7         8 
12345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890 
HELIX    1  HA GLY A   86  GLY A   94  1                                   9    
HELIX    2  HB GLY B   86  GLY B   94  1                                   9    
HELIX   21  21 PRO J  385  LEU J  388  5                                   4     
HELIX   22  22 PHE J  397  PHE J  402  5                                   6    
C# PDF Field Edit Library: insert, delete, update pdf form field
C#.NET Demo Code: Add Form Fields to an Existing PDF File in C#.NET. This C# demo will help you to add form fields to PDF file. String
saving pdf forms in acrobat reader; extract data from pdf c#
.NET PDF Document Viewing, Annotation, Conversion & Processing
XDoc.PDF SDK for .NET is completely developed in .NET, compatible with Visual C#, Visual Basic, and Delphi for .NET. Read form data from PDF form file.
extract pdf form data to excel; extract data from pdf form to excel
PDB File Format v. 3.2 
Page 172 
SHEET 
Overview 
SHEET records are used to identify the position of sheets in the molecule. Sheets are both named 
and numbered. The residues where the sheet begins and ends are noted. 
Record Format 
COLUMNS       DATA TYPE     FIELD          DEFINITION 
------------------------------------------------------------------------------------- 
1 -  6       Record name   "SHEET " 
8 - 10       Integer       strand         Strand number which starts at 1 for each 
strand within a sheet and increases by one. 
12 - 14       LString(3)    sheetID        Sheet identifier. 
15 - 16       Integer       numStrands     Number of strands in sheet. 
18 - 20       Residue name  initResName    Residue name of initial residue. 
22            Character     initChainID    Chain identifier of initial residue  
in strand. 
23 - 26       Integer       initSeqNum     Sequence number of initial residue 
in strand. 
27            AChar         initICode      Insertion code of initial residue 
in strand. 
29 - 31       Residue name  endResName     Residue name of terminal residue. 
33            Character     endChainID     Chain identifier of terminal residue. 
34 - 37       Integer       endSeqNum      Sequence number of terminal residue. 
38            AChar         endICode       Insertion code of terminal residue. 
39 - 40       Integer       sense          Sense of strand with respect to previous 
strand in the sheet. 0 if first strand, 
1 if parallel,and -1 if anti-parallel. 
42 - 45       Atom          curAtom        Registration. Atom name in current strand. 
46 - 48       Residue name  curResName     Registration. Residue name in current  
strand 
50            Character     curChainId     Registration. Chain identifier in 
current strand. 
51 - 54       Integer       curResSeq      Registration. Residue sequence number 
PDB File Format v. 3.2 
Page 173 
in current strand. 
55            AChar         curICode       Registration. Insertion code in 
current strand. 
57 - 60       Atom          prevAtom       Registration. Atom name in previous strand. 
61 - 63        Residue name  prevResName   Registration. Residue name in 
previous strand. 
65             Character     prevChainId   Registration. Chain identifier in 
previous strand. 
66 - 69        Integer       prevResSeq    Registration. Residue sequence number 
in previous strand. 
70             AChar         prevICode     Registration. Insertion code in 
previous strand. 
Details 
* The initial residue for a strand is its N-terminus. Strand registration information is provided in 
columns 39 - 70. Strands are listed starting with one edge of the sheet and continuing to the spatially 
adjacent strand.  
* The sense in columns 39 - 40 indicates whether strand n is parallel (sense = 1) or anti-parallel 
(sense = -1) to strand n-1. Sense is equal to zero (0) for the first strand of a sheet.  
* The registration (columns 42 - 70) of strand n to strand n-1 may be specified by one hydrogen bond 
between each such pair of strands. This is done by providing the hydrogen bonding between the 
current and previous strands. No register information should be provided for the first strand.  
* Split strands, or strands with two or more runs of residues from discontinuous parts of the amino 
acid sequence, are explicitly listed. Detail description can be included in the REMARK 700 .  
Relationships to Other Record Types 
If the entry contains bifurcated sheets or beta-barrels, the relevant REMARK 700 records must be 
provided. See the REMARK section for details.  
Examples 
1         2         3         4         5         6         7         8 
12345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890 
SHEET    1   A 5 THR A 107  ARG A 110  0 
SHEET    2   A 5 ILE A  96  THR A  99 -1  N  LYS A  98   O  THR A 107 
SHEET    3   A 5 ARG A  87  SER A  91 -1  N  LEU A  89   O  TYR A  97 
SHEET    4   A 5 TRP A  71  ASP A  75 -1  N  ALA A  74   O  ILE A  88 
SHEET    5   A 5 GLY A  52  PHE A  56 -1  N  PHE A  56   O  TRP A  71 
PDB File Format v. 3.2 
Page 174 
SHEET    1   B 5 THR B 107  ARG B 110  0 
SHEET    2   B 5 ILE B  96  THR B  99 -1  N  LYS B  98   O  THR B 107 
SHEET    3   B 5 ARG B  87  SER B  91 -1  N  LEU B  89   O  TYR B  97 
SHEET    4   B 5 TRP B  71  ASP B  75 -1  N  ALA B  74   O  ILE B  88 
SHEET    5   B 5 GLY B  52  ILE B  55 -1  N  ASP B  54   O  GLU B  73 
The sheet presented as BS1 below is an eight-stranded beta-barrel. This is represented by a nine-
stranded sheet in which the first and last strands are identical.  
SHEET    1 BS1 9 VAL    13  ILE    17  0                                
SHEET    2 BS1 9 ALA    70  ILE    73  1  O  TRP    72   N  ILE    17   
SHEET    3 BS1 9 LYS   127  PHE   132  1  O  ILE   129   N  ILE    73   
SHEET    4 BS1 9 GLY   221  ASP   225  1  O  GLY   221   N  ILE   130   
SHEET    5 BS1 9 VAL   248  GLU   253  1  O  PHE   249   N  ILE   222   
SHEET    6 BS1 9 LEU   276  ASP   278  1  N  LEU   277   O  GLY   252   
SHEET    7 BS1 9 TYR   310  THR   318  1  O  VAL   317   N  ASP   278   
SHEET    8 BS1 9 VAL   351  TYR   356  1  O  VAL   351   N  THR   318   
SHEET    9 BS1 9 VAL    13  ILE    17  1  N  VAL    14   O  PRO   352   
The sheet structure of this example is bifurcated. In order to represent this feature, two sheets are 
defined. Strands 2 and 3 of BS7 and BS8 are identical. 
SHEET    1 BS7 3 HIS   662  THR   665  0                                
SHEET    2 BS7 3 LYS   639  LYS   648 -1  N  PHE   643   O  HIS   662   
SHEET    3 BS7 3 ASN   596  VAL   600 -1  N  TYR   598   O  ILE   646   
SHEET    1 BS8 3 ASN   653  TRP   656  0                                
SHEET    2 BS8 3 LYS   639  LYS   648 -1  N  LYS   647   O  THR   655   
SHEET    3 BS8 3 ASN   596  VAL   600 -1  N  TYR   598   O  ILE   646   
PDB File Format v. 3.2 
Page 175 
6. Connectivity Annotation Section 
The connectivity annotation section allows the depositors to specify the existence and location of 
disulfide bonds and other linkages.    
SSBOND (updated) 
The SSBOND record identifies each disulfide bond in protein and polypeptide structures by identifying 
the two residues involved in the bond. 
The disulfide bond distance is included after the symmetry operations at the end of the SSBOND 
record. 
Record Format 
COLUMNS        DATA TYPE      FIELD            DEFINITION 
-------------------------------------------------------------------------------- 
1 -  6        Record name    "SSBOND" 
8 - 10        Integer        serNum           Serial number. 
12 - 14        LString(3)     "CYS"            Residue name. 
16             Character      chainID1         Chain identifier. 
18 - 21        Integer        seqNum1          Residue sequence number. 
22             AChar          icode1           Insertion code. 
26 - 28        LString(3)     "CYS"            Residue name. 
30             Character      chainID2         Chain identifier. 
32 - 35        Integer        seqNum2          Residue sequence number. 
36             AChar          icode2           Insertion code. 
60 - 65        SymOP          sym1             Symmetry operator for residue 1. 
67 - 72        SymOP          sym2             Symmetry operator for residue 2. 
74 – 78        Real(5.2)      Length           Disulfide bond distance 
 
Details 
* Bond distances between the sulfur atoms must be close to expected value.  
* sym1 and sym2 are right justified and are always given even when identity operator (no cell 
translation) is to be applied to the residue.  
PDB File Format v. 3.2 
Page 176 
Verification/Validation/Value Authority Control  
wwPDB processing programs generate these records automatically 
Relationships to Other Record Types  
CONECT records are generated for the disulfide bonds when SG atoms of both cysteines are present 
in the coordinate records.  
Example 
1         2         3         4         5         6         7         8 
12345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890 
SSBOND   1 CYS A    6    CYS A  127                          1555   1555  2.03  
SSBOND   2 CYS A   30    CYS A  115                          1555   1555  2.07  
SSBOND   3 CYS A   64    CYS A   80                          1555   1555  2.06  
SSBOND   4 CYS A   76    CYS A   94                          1555   1555  2.04  
Known Problems  
If SG of cysteine is disordered then there are possible alternate linkages. wwPDB practice is to put 
together all possible SSBOND records. This is problematic because the alternate location identifier is 
not specified in the SSBOND record. 
Documents you may be interested
Documents you may be interested